科研产出
甘薯KUP/HAK/KT基因家族的全基因组鉴定和表达模式分析
《西南农业学报 》 2022 北大核心 CSCD
摘要：[目的]鉴定与分析甘薯KUP/HAK/KT基因家族,为进一步深入对IbHAK基因功能研究提供理论基础.[方法]基于生物信息学手段,利用泰中6号基因组数据,在全基因组水平对甘薯KUP/HAK/KT基因家族进行鉴定,同时进一步对家族成员的基本特征、系统进化、基因复制和表达模式进行分析.[结果]在甘薯中共鉴定到22个IbHAK基因,蛋白质长度为227~1252 aa,分子量为18 297.95~140 640.46 u,等电点为5.54~9.31,全部定位于质膜上,蛋白完整的二级结构有4~13个跨膜区.依据系统进化关系,将其分为Cluster Ⅰ、Cluster Ⅱ、ClusterⅢ和ClusterⅣ 4个进化簇.染色体定位结果显示22个基因分布在11条染色体上,其中Chr4染色体上分布最多,有4个IbHAK基因,22个IbHAK基因中共产生8个复制基因.22个IbHAK基因都含有TATA和CAAT调控植物生长发育相关元件以及光响应元件,且所有的IbHAK基因至少含有1种逆境响应元件和1种激素响应元件.IbHAK基因呈现出组织表达特异性,其中IbHAK6、IbHAK8、IbbHAK9、IbHAK22在根中表达量最高,逆境胁迫下多个IbHAK基因出现表达量变化.[结论]从甘薯全基因组鉴定22个KUP/HAK/KT基因家族成员,甘薯KUP/HAK/KT基因家族成员在进化上比较保守,IbHAK6、Ibb-HAK8、IbHAK9、IbHAK22在甘薯根形成过程中发挥作用,大部分IbHAK基因能够响应逆境胁迫.
关键词： 甘薯 IbKUP/HAK/KT基因家族 生物信息学 逆境胁迫
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人参加工副产品对吉林芦花鸡肌肉和鸡蛋中皂苷累积的影响
《东北农业科学 》 2022 北大核心 CSCD
摘要：为充分利用人参加工副产物，提高畜禽产品附加值，本研究在分析人参茎叶和投料参（芦头和须根）皂苷组成和含量的基础上，采用随机化完全区组试验设计，以吉林芦花鸡为试验对象，开展三个阶段试验（0～150日龄、120～150日龄和150～180日龄），观察不同阶段、不同添加水平人参茎叶和投料参对芦花鸡肌肉和鸡蛋中人参皂苷累积数量和累积种类的影响。结果表明，人参茎叶和投料参中单体皂苷均可有效富集在芦花鸡胸肌和鸡蛋产品中；生产富含皂苷的人参保健鸡肉和人参保健鸡蛋可选择在芦花鸡出栏前一个月或产蛋前期添加人参茎叶和投料参，日粮中适宜添加量分别为0.6%～1.2%和0.2%～0.4%。
关键词： 人参茎叶 投料参 吉林芦花鸡 肌肉 鸡蛋 人参皂苷
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南果梨PuLOX2S基因的鉴定及与PuWRKY、PuMYB转录因子家族成员互作研究
《北方园艺 》 2022 北大核心
摘要：以南果梨为试材,采用Tail-PCR、Y1H技术以及生物信息学方法,研究了PuLOX2S启动子结构与PuWRKY、PuMYB转录因子家族成员的互作关系,以期揭示PuLOX2S基因的调控元件.结果表明:PuLOX2S蛋白质与亚麻荠CsatLOX6、西洋白花菜ThjLOX6的亲缘关系较近,蛋白质二级结构中无规则卷曲占42.17%比例最高,该蛋白质在细胞质基质中发挥生物学作用;PuLOX2S基因启动子含ABRE、CAAT-box、TGACG-motif等多个转录因子结合位点;PuLOX2S-pro能够与PuWRKY2与PuMYB44发生显著互作,但与PuWRKY21互作不显著.该研究为深入解析南果梨香气合成分子机制提供了重要信息.
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苹果脱水素基因生物信息学识别与表达分析
《分子植物育种 》 2022 北大核心 CSCD
摘要：本研究使用Perl语言在'金冠'苹果基因组中识别脱水素基因(MD-DHN)序列,并对MD-DHN系统发生关系、保守序列、氨基酸一级结构以及疏水性等进行了生物信息学分析,并利用低温处理下'金红'、'金冠'苹果转录组测序数据,分析了 MD-DHN表达差异.在'金冠'苹果基因组中,共识别17个MD-DHN,根据系统发生关系可以归类为Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ 3个亚族,Ⅰ类亚族的成员最多,Ⅲ类亚族最少,均包含Y、S、K序列区,但Ⅰ类亚族K区一致性不高.17个MD-DHN蛋白都具有高亲水性,但是不同蛋白序列之间亲水性存在差异.17个MD-DHN中,有11个MD-DHN响应苹果冷胁迫和冰冻胁迫,其中10个脱水素基因(MDDHN1~MD-DHN5,MD-DHN8~MD-DHN10,MD-DHN13和MD-DHN 15)在冰冻胁迫下,在更耐寒'金红'苹果中高表达.本研究为进一步探讨MD-DHN基因功能提供了依据.
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非洲猪瘟病毒p30蛋白单克隆抗体制备及线性抗原表位定位
《中国农业科学 》 2022 北大核心 CSCD
摘要：[目的]制备非洲猪瘟病毒(African swine fever virus,ASFV)p30蛋白的单克隆抗体(monoclonal antibodies,MAbs)并初步分析其所识别的线性抗原表位,为ASFV及其抗体检测方法的建立及p30蛋白结构和功能的研究奠定基础.[方法]将原核表达并纯化的p30重组蛋白作为免疫原,免疫6—8周龄BALB/c雌鼠,每两周免疫1次,共免疫3次,首次免疫是抗原与等体积的弗氏完全佐剂乳化后免疫,第二次和第三次免疫与等体积的弗氏不完全佐剂乳化,3次免疫后1 w断尾采血,间接酶联免疫吸附试验(ELISA)检测血清抗体效价,选择血清效价最高的小鼠进行加强免疫,3 d后取小鼠脾淋巴细胞与SP2/0骨髓瘤细胞按照4﹕1的比例使用PEG进行常规细胞融合.利用重组p30蛋白作为包被抗原,间接ELISA筛选阳性杂交瘤细胞,有限稀释法进行克隆纯化,直至筛出能够稳定分泌抗体的MAbs.将ASFV接种于猪肺泡巨噬细胞,以筛选的MAbs为一抗、兔抗鼠HRP-IgG为二抗,进行间接免疫荧光试验(IFA).将感染和未感染ASFV的细胞沉淀处理后进行SDS-PAGE并转印至硝酸纤维素膜,分别以IFA鉴定为阳性的MAbs上清为一抗、兔抗鼠HRP-IgG为二抗,进行Western blotting分析,筛选获得p30 MAbs.根据已知序列设计引物扩增p30ab与p30bc两段截短基因,其中p30ab代表由第86—153位氨基酸残基的截短体,p30bc代表由第120—187位氨基酸残基的截短体,原核表达部分重叠的截短p30蛋白,最终获得重组蛋白GST-p30ab与重组蛋白GST-p30bc.分别以GST-p30ab和GST-p30bc融合蛋白为包被抗原,以5株MAbs为一抗,以兔抗鼠HRP-IgG为二抗,通过间接ELISA方法初步定位p30蛋白的抗原表位.[结果]以纯化的重组蛋白为包被抗原,经间接ELISA试验筛选出25株可分泌抗重组p30蛋白的杂交瘤细胞株.IFA结果显示,5株MAbs(8F4、1D3、1H2、6C3和8E11)与ASFV感染的猪肺泡巨噬细胞IFA试验呈阳性;Western blotting结果显示,5株MAbs均能够与ASFV感染的细胞呈阳性反应,与未感染病毒的细胞呈阴性反应.试验构建的p30截短体重组蛋白GST-p30ab以可溶和包涵体两种形式表达,而GST-p30bc仅以包涵体形式表达,以两组截短体融合蛋白为包被抗原,通过间接ELISA检测出MAbs 8F4、1H2和6C3与两个重组蛋白均能有效结合,证明MAbs 8F4、1H2和6C3抗原识别区域为两组截短蛋白重叠区域,即第120—153位氨基酸;MAbs 8E11与1D3则只能与GST-p30ab蛋白结合,证明MAbs 8E11与1D3抗原识别区域为两个重组蛋白的非重叠区域,即第86—119位氨基酸.[结论]本研究可溶性地表达了p30蛋白的第86—153位氨基酸截短体重组蛋白,制备了5株p30 MAbs,定位到2个p30蛋白抗原表位.结合ELISA和IFA,可建立十分可靠的ASFV及其抗体的检测手段.
关键词： 非洲猪瘟病毒 p30蛋白 酶联免疫吸附试验 单克隆抗体 抗原表位
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坡耕地嵌入覆盖作物条件下不同秸秆还田方式对玉米农艺性状及产量的影响
《玉米科学 》 2022 北大核心 CSCD
摘要：2016年，在吉林省东部坡耕地玉米生产上设计秸秆覆盖还田+覆盖作物（T1）、秸秆深翻还田+覆盖作物（T2）、秸秆粉耙还田+覆盖作物（T3）、秸秆离田（CK）4种种植方式的定位试验，通过玉米秸秆还田结合种植覆盖作物解决冬季土壤裸露、培肥地力、改善玉米生产等问题。2019～2020年，分析不同处理方式对玉米农艺性状及产量的影响。结果表明，与CK处理相比，T1、T2和T3处理对株高、叶数、SPAD值、干物质积累均有提高。在拔节期和开花期，T3处理的叶面积指数对比CK显著提高。在成熟期，T1、T2和T3处理比CK显著增加千粒重，增幅均在5%以上（P＜0.05）。各秸秆处理的产量对比CK均有显著增加，其中，T3处理为最佳处理。利用秸秆还田结合覆盖作物的种植方式有利于地上部生物量和养分的积累，进而提高产量。
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高粱抗性淀粉辅助治疗胃癌的研究
《江苏农业科学 》 2022 北大核心
摘要：高粱抗性淀粉对于多种疾病有治疗作用,通过体内及体外试验共同验证其辅助抑制肿瘤增殖的作用,评价高粱抗性淀粉与罗米地辛联合应用对胃癌的治疗作用.结果表明,在体内试验中,罗米地辛组肿瘤抑制率为34.6%,高粱抗性淀粉+罗米地辛组肿瘤抑制率为44.1%,高粱抗性淀粉+罗米地辛组对裸鼠肿瘤组织的增殖速度抑制更加明显;在体外试验中,抗性淀粉+罗米地辛模型组与罗米地辛组相比同样表现出更强的抑制SGC-7901细胞增殖的能力,2组药物将SGC-7901细胞周期阻滞在G1期,其机制是通过降低肿瘤细胞中STAT5 A、cyclin-D1蛋白的表达而实现的.综合以上结果可以推断高粱抗性淀粉可增强罗米地辛抑制胃癌增殖的作用,达到辅助治疗胃癌的目的.
关键词： 高粱抗性淀粉;罗米地辛;胃癌;肿瘤增殖
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轮耕对吉林省西部春玉米田土壤团聚体和产量的影响
《吉林农业大学学报 》 2022 北大核心 CSCD
摘要：为了揭示秸秆全量还田条件下不同轮耕模式对吉林省西部旱作玉米田土壤团聚体稳定性和玉米产量的影响，于2017至2019年开展旋耕/旋耕/旋耕（T1）、翻耕/旋耕/旋耕（T2）、翻耕/免耕/免耕（T3）和翻耕/旋耕/免耕（T4）轮耕试验。测定和分析了4个处理土壤团聚体含量、稳定性、有机质含量和玉米产量。结果表明：干筛下，土壤力稳性团聚体含量(R＞0.25)、平均质量直径（MWD）、几何平均直径（GMD）、分形维数（D）和有机质含量无显著差异。湿筛下，0～20 cm和20～40 cm土层，T4的水稳性团聚体含量比T1显著提高了11.9%、9.4%。0～20 cm土层，T4的MWD比T1、T2显著提高了15.9%、11.4%;20～40 cm土层，T4的MWD比T2显著提高了11.1%。0～20 cm土层，T4的GMD比T2显著提高了5.6%,T4的D比T1显著降低了4.0%;20～40 cm土层，T3和T4的D比T1显著降低了2.4%和3.2%;0～40 cm土层，T4的不稳定团粒指数(Elt)比T2显著降低了14.0%。与T2相比，T3、T4在20～40 cm土层的团聚体破坏率（PAD）显著降低了23.1%、23.8%。0～20 cm土层中水稳性团聚体有机质含量随粒径减小而降低。T3、T4能增强0～40 cm土层土壤团聚体稳定性，然而T2、T3、T4 3年产量的平均值却比T1降低了12.7%、7.8%、8.1%。综合考虑土壤团聚体稳定性和玉米产量及其稳产水平，T3为最佳轮耕模式。
关键词： 秸秆全量还田 轮耕 春玉米 土壤团聚体 产量 吉林省西部
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玉米禾谷镰孢穗腐病抗性鉴定接种方法比较
《玉米科学 》 2022 北大核心 CSCD
摘要：通过子粒注射法和花丝通道法，在玉米吐丝初期至乳熟后期间隔5～127 d接种3个不同玉米品种，明确东北地区玉米禾谷镰孢穗腐病抗性鉴定的最佳接种方法。结果发现，禾谷镰孢在玉米吐丝期至乳熟期均能侵染玉米子粒和花丝。子粒注射法在玉米吐丝1～12 d内接种的病情指数显著高于16 d以后接种的处理；花丝通道法在玉米吐丝1～5 d内的病情指数显著高于12 d以后接种的处理。子粒注射法的抗性鉴定结果为吐丝1 d接种的果穗表现为感病，吐丝5～12 d为中抗或抗病，吐丝16 d之后为抗病或高抗；花丝通道法接种的结果为吐丝1 d为中抗或抗，吐丝5 d及以后为抗或高抗。结果表明，子粒注射法在玉米吐丝10～15 d左右接种发病稳定、抗感差异明显、鉴定结果准确。
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不同耕作措施土壤结构特征及其影响因素的研究进展
《玉米科学 》 2022 北大核心 CSCD
摘要：综述不同耕作措施下土壤团聚体稳定性和孔隙结构特征的研究进展，归纳总结影响土壤结构稳定性的主要因素。结果表明，与传统翻耕相比，免耕、深松及其秸秆覆盖还田增加表层土壤大团聚体含量及稳定性，提高大孔隙数量和孔隙度。轮耕系统对土壤结构的影响在不同气候区域和土壤类型间差异较大。土壤结构稳定性与铁铝氧化物形态变化、有机质含量、蚯蚓数量、微生物和线虫丰度及多样性、根系构型及其分泌物、干湿交替及冻融交替次数等因素相关。针对目前研究现状，提出建立长期保护性耕作和轮耕体系监测系统，从铁铝氧化物形态变化、土壤微食物网结构和功能、根系驱动等研究方向进一步解析旱地耕作对土壤结构的影响机制。
关键词： 玉米 耕作措施 土壤团聚体 土壤孔隙结构 土壤微生态环境 根系
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