科研产出
基因组测序分析广叶绣球菌SP-A菌株的遗传差异
《菌物学报 》 2021 北大核心 CSCD
摘要：广叶绣球菌Sparassis latifolia是一种极具开发潜力的食药用真菌,新品种的选育是其产业发展的迫切需求。绣球菌新品种‘SP-A’是福建省农业科学院选育的绣球菌工厂化栽培新品种,但由于缺少基因组信息,严重阻碍了其相关基础研究。本研究利用高通量测序技术,对‘SP-A’全基因组进行测序,获得了1.58Gb高质量测序数据,Q30达到95.55%。与‘闽绣1号’参考基因组平均比对率为76.86%,平均覆盖深度为28X,基因组覆盖度为93.51%,共检测到273587个单核苷酸多态位点,40772个小片段插入缺失位点,这些变异共导致了7954个基因变异。研究初步揭示了‘SP-A’的基因组特征,为相关分子标记筛选及辅助育种、遗传分析和功能基因克隆提供了重要的分子标记资源。
关键词： 绣球菌 基因组 测序 单核苷酸多态位点 小片段插入缺失
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龙眼Aux/IAA基因家族全基因组鉴定及表达分析
《果树学报 》 2021 北大核心 CSCD
摘要：【目的】Aux/IAA作为重要的生长素原初响应因子参与到植物的各个生长发育阶段。为了解Aux/IAA家族基因在龙眼花芽分化过程中的作用,对DlIAA基因家族进行全基因组鉴定和分析,并研究其在外源激素处理下的表达模式。【方法】利用生物信息学方法对Aux/IAA基因家族进行全基因组鉴定与分析,基于RNA-seq数据库分析DlIAA基因家族的表达,利用qRT-PCR探究DlIAA基因家族在龙眼花芽分化过程中和外源IAA处理下的表达情况。【结果】利用龙眼参考基因组数据,鉴定出18个DlIAA基因,依据龙眼、苹果、拟南芥和番茄之间的系统发育关系,可将进化树分为4大类7个亚族。结果表明,DlIAA基因家族与苹果具有较高的同源性,而与拟南芥、番茄的亲缘关系较远。基因结构和结构域中同一类群的不同DlIAA基因家族成员具有较高的相似度。启动子中顺式元件的分布表明,DlIAA基因表达不仅受生长素（AuxREs、TGA-element和TGA-box）的调节,还受其他激素和生长环境的调节。DlIAA基因家族在龙眼9个不同组织中表现出不同的表达模式,且部分DlIAA基因为组织特异性基因。通过对不同品种龙眼花芽的3个RNA-seq数据库筛选发现,有5个候选基因（D1IAA2、D1IAA4、D1IAA7、D1IAA15和D1IAA17）均显示出较低的表达量,表明其功能与龙眼花芽分化可能存在一定的关系。进一步的qRT-PCR分析表明,DlIAA2和DlIAA17可能在开花诱导中起作用。DlIAA对外源IAA的反应结果表明,5个候选基因在100μmol·L-1IAA处理下被不同程度地诱导表达,且在500μmol·L-1浓度下均显著上调。【结论】转录组数据显示DlIAA基因参与了龙眼花芽分化过程,DlIAA2和DlIAA17可能在开花诱导中起作用。
关键词： 龙眼 Aux/IAA基因家族 生物信息学 定量分析
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不同温度下豆蚜在闽南饲用(印度)豇豆上的发育及试验种群生命表
《草业科学 》 2021 北大核心 CSCD
摘要：为评估牧草、绿肥兼用草种闽南饲用（印度）豇豆（Vigna unguiculata）作为载体植物扩繁豆蚜（Aphis craccivora）的适合性,开展了不同温度下闽南饲用（印度）豇豆对豆蚜存活率、发育历期、繁殖力影响的研究,并构建了种群生命表。结果表明:在17～33℃,豆蚜的世代发育历期随温度的升高而缩短;21℃时豆蚜的产蚜量最高,为103.90只;净增殖率随温度升高而降低,33℃时最低（1.378）,17℃最高（54.649）;在17～33℃,内禀增长率在25℃时最大（0.338）,33℃时最小（0.041）;周限增长率在25℃时最高（1.403）,33℃时最低（1.042）;种群加倍时间在25℃时最低,为2.049 d。闽南饲用（印度）豇豆具备载体植物的潜力,对建立以闽南饲用（印度）豇豆为纽带的载体植物系统有一定的启发。
关键词： 牧草 绿肥 载体植物 发育历期 生命表 存活率 净增殖率
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水稻强再生力种质创制及遗传分析
《科学通报 》 2021 北大核心 CSCD
摘要：当前直接选育的再生稻专用品种较少,其制约的关键要素在于强再生力种质的缺乏.选用8个生产上大面积应用的恢复系,按4×4不完全双列杂交方式,通过系谱法进行定向选择和种质创新,以再生芽出鞘率为指标,采用加性-显性遗传模型,对恢复系再生力的遗传特性进行研究.结果表明:（1）再生力性状受控于加性效应基因和显性效应基因的共同作用,同时易受环境条件与栽培技术的影响;（2）再生力性状狭义遗传率（h2N）和广义遗传率（h2B）的估计值均达显著或极显著水平,而且广义遗传率明显大于狭义遗传率;（3）恢复系闽恢3301和亚恢627的再生力性状具有极显著或显著的正向加性效应和负向显性效应,适合作为筛选强再生力的亲本材料;（4）创制的新种质Ra201、Ra202、Ra212再生芽出鞘率较高,再生力强,其中Ra202低节位腋芽萌发优势明显,可作为亲本用于籼型水稻再生力基因挖掘和利用;（5）再生稻品种选育方法的研究进一步完善了传统育种技术,具有间接鉴定和早期筛选的优点,新种质创制和新品种选育取得了良好成效.
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基于移动LBS服务的红火蚁疫情调查系统构建与应用
《植物检疫 》 2021 北大核心
摘要：针对红火蚁（Solenopsis invicta Buren）疫情调查时间紧、数据汇总工作量大、调查分工协作困难等问题,开发基于位置服务（Location Based Service,LBS）的红火蚁疫情调查系统,实现红火蚁疫情数据高效采集、调查协同实施、疫情分布展示、数据云端备份等功能。通过定位信息自动采集、预设标准化表格和枚举描述性选项,使调查工作更加的方便、规范,有效提高了调查数据的精度,便于进一步分析数据。该调查系统应用于2017年平潭综合试验区红火蚁疫情调查,收集了69 182份红火蚁蚁巢分布数据,平均每人每天调查数据量达到118.26条,调查覆盖平潭主岛11个乡镇,调查成果准确反映了平潭主岛红火蚁疫情发生分布情况。通过与国内同类调查案例比较,运用移动终端的LBS服务开展红火蚁调查能够极大提高调查效率,为红火蚁防控提供精准的决策数据支持,应用前景广阔。
关键词： 位置服务（LBS） 红火蚁 疫情调查 调查系统 平潭综合实验区
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喷施农药对银耳生长的影响及膳食暴露风险评估
《热带亚热带植物学报 》 2021 北大核心 CSCD
摘要：为制订银耳（Tremella fuciformis）栽培中农药合理使用的建议,以我国银耳主栽菌株Tr01为对象,研究8组常用农药对其生长的影响,采用食品安全指数法评估长期膳食银耳导致的农药残留慢性暴露健康风险。结果表明,除咪鲜胺乳油和哒螨灵、啶虫脒微乳剂的部分处理外,其余6组农药对银耳子实体生长并无显著影响。银耳中的农药残留水平与农药种类及喷施模式密切相关,当农药残留水平低于GB 2763-2019标准中蔬菜的农药最大残留限量时,成人和儿童长期膳食银耳的慢性健康风险商（cHQ）分别为0.001～0.174和0.002～0.191,风险水平可接受。结合我国农药使用现状,建议银耳栽培中应禁用乙酰甲胺磷、毒死蜱、克百威,减少阿维菌素、咪鲜胺、异丙威的使用频率,在合适的安全间隔期下可以使用联苯菊酯、啶虫脒、吡虫啉、哒螨灵。
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鸭丙型肝炎病毒TB Green实时荧光定量PCR方法的建立
《农业生物技术学报 》 2021 北大核心 CSCD
摘要：鸭丙型肝炎病毒（Duck hepacivirus, DuHCV）是近年来从临床表现为产蛋异常鸭（Anas）群中新发现的一种丙型肝炎病毒。为建立DuHCV的分子生物学检测方法用于该病的流行病学调查并进一步探究其致病机制,本研究根据NCBI数据库中DuHCV参考株（HCL-2株, GenBank No. MK737640.1）的NS5B基因特征,设计特异性引物,建立检测DuHCV的TB Green实时荧光定量PCR方法。结果显示,建立的检测DuHCV的TB Green实时荧光定量PCR方法,灵敏度高,最低检测限为64拷贝/μL;特异性好,与鸭群常见传染病病原均无交叉反应,扩增产物的熔解曲线仅DuHCV出现1个特异性单峰,Tm值为（82.22±0.21）℃;重复性好,组内和组间重复试验变异系数分别为0.13%～0.54%和0.53%～1.12%。利用建立的TB Green实时荧光定量PCR方法和常规逆转录PCR （reverse transcription PCR, RT-PCR）方法同时对103份临床样品进行DuHCV感染的检测,结果显示,RT-PCR方法检出阳性样品8份,阳性率为7.8%;TB Green实时荧光定量PCR方法检出阳性样品11份,阳性率为10.68%,且8份RT-PCR阳性样品经TB Green实时荧光定量PCR方法检测均为阳性,符合率为100%。本研究为后续开展DuHCV感染的分子流行病学调查和致病机理研究提供技术支撑。
关键词： 鸭丙型肝炎病毒 NS5B基因 TB Green实时荧光定量PCR
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一株金龟子绿僵菌对茶尺蠖的致病力和胞外酶活性
《中国生物防治学报 》 2021 北大核心 CSCD
摘要：为明确从茶园腐殖层昆虫尸体上分离的虫生真菌的分类地位及其对茶尺蠖的生防潜力,采用形态学特征观察和rDNA-ITS序列分析方法对该菌株进行鉴定,并测定该菌株对茶尺蠖4龄幼虫的毒力及其胞外酶活性。结果表明,从茶园腐殖层虫尸上分离获得一株金龟子绿僵菌CHMA-005;该菌株侵染茶尺蠖4龄幼虫10 d后,致死率、 LC50和LT50分别可达100%、1.84×104cfu/mL和3.57d;蛋白酶活性和几丁质酶活性均在第6 d达到最大值,分别为31.43和27.73 U/mL。可见,金龟子绿僵菌CHMA-005对茶尺蠖的致病力强,胞外酶活性高,具有良好的生防潜力和应用前景。
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福建省果园水肥一体化配置和使用现状调查
《中国果树 》 2021 北大核心
摘要：采用实地访谈的方法调查了福建省45个县（市）1 800个农户不同果园的施肥现状,并深入了解水肥一体化设备配置及使用情况。调查结果表明:使用水肥一体化技术的农户较少,仅占调查户数的14.91%,其中葡萄园使用水肥一体化的户数最多;在水肥一体化3种模式中,重力式水肥一体化最常见,占调查户数的82.07%,自动化操作中以手动最多,占调查户数的74.50%,而远程控制和全自动操作分别仅占1.20%和3.59%;水肥一体化中注肥设备和出水方式最常使用重力自压式和滴灌,分别占调查户数的86.85%、40.63%,而过滤系统操作主要是以手动为主,占调查户数的81.27%;滴灌作为水肥一体化最常用的出水方式,可以起到节水省肥的作用,且对肥料的水溶性要求较高,含杂质极少,另外在水肥一体化规范模式中占比较高,为55%;施肥量方面,在相同产量水平下,采用水肥一体化施肥可使施肥量减少10%～15%,同时发现水肥一体化围绕关键期施肥的比率较小,缺乏合理的施肥策略,省肥力度还不够,需进一步深入研究。
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