科研产出
甘薯卷叶病毒的RPA检测方法的建立
《福建农业学报 》 2021 CSCD
摘要:【目的】建立快速检测甘薯卷叶病毒重组酶聚合酶(RPA)等温扩增方法,为甘薯卷叶病毒(sweet potato leaf curl virus,SPLCV)提供快速、简便的检测方法。【方法】根据甘薯卷叶病毒AV1基因的保守区段设计RPA检测用引物,并对引物进行筛选,对反应条件和反应体系进行优化,建立SPLCV的RPA检测方法。【结果】建立的甘薯卷叶病毒RPA方法快速简便,39℃反应20 min完成检测;灵敏度高,最低检测限为10 pg·μL-1;特异性强,与感染番茄黄化卷叶病毒(TYLCD),甘薯羽状斑驳病毒(SPFMV)、甘薯G病毒(SPVG)、甘薯退绿矮化病毒(SPCSV)等4种DNA病毒均无交叉反应。【结论】建立的RPA检测方法具有快速、灵敏、特异性强、不需要特殊仪器等优点,适合田间甘薯卷叶病毒样品的快速检测。
关键词: 甘薯 卷叶病毒(SPLCV) 重组酶聚合酶等温扩增方法 检测
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水稻稻瘟病拮抗稀有放线菌的筛选及防治效果
《中国生物防治学报 》 2021 北大核心 CSCD
摘要:为获得对水稻稻瘟病菌具有良好抑菌效果的稀有放线菌,从红豆杉根际土壤样品中分离获得11株放线菌,筛选出对水稻稻瘟病菌抑菌效果最好的菌株ST7-2,抑菌率为79.88%,经形态特征、生理生化特征观察和16S rRNA、recA、gyrB、rpoB序列分析,确定菌株ST7-2为杀结节链霉菌Streptomyces tubercidicus。菌株ST7-2对水稻稻瘟病菌Magnaportheoryzae、大豆炭疽病菌Colletotrichumtruncatum、芦笋茎枯病菌Phomopsis asparagi、水稻稻曲病菌Ustilaginoidea virens、蘑菇褐腐病菌Mycogone perniciosa共5种病原真菌具有较好的抑菌效果。室内盆栽试验结果表明,菌株ST7-2发酵液对水稻苗瘟防效为82.76%,与75%三环唑可湿性粉剂1700倍无显著性差异;田间小区试验结果显示,发酵液对水稻穗颈瘟防效为73.57%,比75%三环唑WP1700倍的防效略低。因此,杀结节链霉菌ST7-2是防治水稻稻瘟病的潜在生防菌株,生防应用前景广阔。
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基于SLAF-seq技术枇杷SNP位点开发
《分子植物育种 》 2021 北大核心 CSCD
摘要:利用SLAF-seq测序技术,开发一批特异性强、稳定性高的单核苷酸多态性(SNP)位点,为枇杷遗传图谱构建、分子辅助育种和物种进化等研究提供理论依据。本研究共收集294份枇杷属资源,利用SLAF-seq测序技术进行测序。以梨基因组为参考基因组进行电子酶切预测,确定使用HaeⅢ+Hpy166Ⅱ进行酶切,构建SLAF-seq文库,而后筛选314~364 bp长度的DNA片段定义为SLAF标签,预测可得到116 171个SLAF标签。共获得526.63 M reads数据,各样品所获得的读长数目在119 893~9 305 152范围内,平均读长为1 787581;测序质量值Q30的范围在88.26%~95.67%,平均为93.61%;GC含量分布在38.79%~42.92%范围内,平均值为40.35%。本实验以水稻测序获得0.16 M reads的数据量为Control,双端比对效率在91.28%,说明SLAF建库基本正常。生物信息学分析结果显示本研究共获得623 356个SLAF标签,且有123 498个多态性的标签,多态性为19.81%。在多态性SLAF标签上开发得到1 604 434个群体SNP标记。根据完整度>0.8,MAF>0.05过滤,共得到95 960个高一致性的群体SNP。
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以黄浆水为基质的芽孢杆菌制剂制备工艺优化及功效分析
《福建农业学报 》 2021 CSCD
摘要:【目的】利用豆腐黄浆水为发酵原料制备芽孢杆菌制剂,降低芽孢杆菌制剂生产成本,提高菌制剂活菌数。【方法】利用豆腐黄浆水发酵制备枯草芽孢杆菌SB13和地衣芽孢杆菌BL14菌制剂,并以菌落数为指标,采用单因素试验进行制备工艺优化;通过体外模拟消化及DNS法分析其作为饲料添加剂的功效。【结果】菌株SB13和BL14在黄浆水基质中均能正常生长,其产孢最佳温度为35℃,最适培养时间分别为72 h和48 h,最佳保护剂分别为10%脱脂奶粉和4%蔗糖,最适载体分别为10%麦耚和10%淀粉,最适干燥工艺均为冷冻干燥。此工艺条件下,SB13和BL14菌制剂的活菌数分别为6.40×108和9.80×108 cfu·mL-1,菌存活率分别为97.71%和94.69%。两种菌制剂经过人工胃、胰液处理2 h后,菌存活数在2.55×107~13.10×107 cfu·mL-1,内切葡聚糖酶活保存率均大于39%(胃液)和72%(胰液),并对鸡、猪和牛饲料均有显著的糖化作用。其中,菌株BL14对金黄色葡萄球菌有显著抑制效果。【结论】实现了黄浆水在芽孢杆菌制剂生产中的创新应用,降低了生产成本;通过工艺优化提高了菌制剂中的单位活菌数;制备的芽孢杆菌制剂有助于促进畜禽对饲料的吸收利用,其中菌制剂BL14还可应用于金黄色葡萄球菌感染的畜禽治疗。
关键词: 芽孢杆菌制剂 载体 保护剂 内切葡聚糖酶 豆腐黄浆水
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60Co-γ辐射荷兰鸢尾突变株性状分析
《核农学报 》 2021 北大核心 CSCD
摘要:为了探究荷兰鸢尾60Co-γ辐射突变株具备的主要可区别性状的评判指标,根据球根鸢尾的测试指南,对其中4个稳定的突变株5-7CBS、7-10SLZ、7-10QLS、10ZLL以及野生型展翅品种进行植物学农艺性状测评,分析比较其主要观赏性状的异同。结果表明,突变株与野生型的植株形态、开花期以及生育期等特征特性基本保持一致;在调查的40个性状中,不同突变株的垂瓣上部上表面底色、旗瓣颜色、花柱上表面颜色、羽冠上表面颜色、垂瓣下部上表面底色等5个假质量性状的表达状态,与野生型相比均具有明显差异;另外的35个性状表达基本一致,相应的表型高度相似,数值较为相近,无明显差异。表明荷兰鸢尾花色在辐射育种中具有较大的遗传改良潜力,推测花色变异可能是辐射突变株与野生型具备可区别性的一个重要性状评判指标,依据花朵颜色的表达状态,花色变异可划分为加强型、野生型、减弱型、全变型4个类型。本研究结果可为开展荷兰鸢尾新品种创制提供基础数据和参考依据。
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杂交水稻苗期杂种优势及基因表达与产量的关系分析
《农业生物技术学报 》 2021 北大核心 CSCD
摘要:植物在发育早期就呈现出明显的杂种优势,苗期是水稻(Oryza sativa)株型形态建成和产量形成的重要时期.为了解苗期杂种优势及基因表达与产量杂种优势的相关性、探索通过水稻苗期表现预测杂交稻产量潜力的可能性,本研究选取杂交水稻有代表性亲本18份,配制45个不完全双列杂交组合,系统考查杂交组合苗期根和苗的杂种优势、基因表达及其与单株产量之间的关系.研究结果表明,同一时期根和苗的性状间、同一组织不同时期性状间都有相关性,苗期性状间有12对性状相关性显著(P<0.05),有2个苗期性状与田间单株产量呈正相关(P<0.05);杂交稻组合在萌发早期(发芽第3天,3 d after sowing,3DAS)杂种优势最高;6个苗期性状的中亲优势(middle parent heterosis,MPH)有13对性状正相关(P<0.01),根长-3DAS,根长-14DAS,株高-3DAS的MPH和单株产量MPH正相关(P<0.05);分析了4个根系发育相关基因在杂交稻组合和亲本间播种后第17天的表达模式,有3个基因与第17天植株的根干重和苗干重相关,4个基因的表达水平均与田间单株产量呈显著相关(P<0.05).杂交水稻组合在种子萌发早期就表现出极强的杂种优势,苗期根和苗各性状间的杂种优势普遍具有相关性.部分性状的杂种优势以及与性状相关的基因表达水平与成熟期单株产量显著相关.本研究为利用水稻早期性状预测产量杂种优势模型的建立和杂交水稻新品种选育提供了理论基础.
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谷优676作再生稻大面积示范高产栽培技术
《杂交水稻 》 2021 北大核心 CSCD
摘要:谷优676是福建省农业科学院水稻研究所和福建兴禾种业科技有限公司以抗稻瘟病不育系谷丰A与高配合力优质恢复系福恢676配组育成的杂交中稻组合,2017年通过福建省农作物品种审定委员会审定。2017—2019年,该组合在闽中山区尤溪县作再生稻示范,头季平均产量12.37 t/hm2,再生季平均产量7.23 t/hm2,两季总产量19.60 t/hm2,最高总产量达19.68 t/hm2,表现抗稻瘟病、产量高、适应性好,非常适合作再生稻种植。总结了该组合在福建省作再生稻的高产栽培技术。
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嘉宝果果实发育过程中营养成分的动态变化
《浙江农业学报 》 2021 北大核心 CSCD
摘要:以不同发育阶段嘉宝果果实为试材,研究其感官特征和营养成分动态变化规律,旨在为适期采收提供参考依据。结果表明,花后30 d果皮颜色青绿,单果质量4.88 g,果实直径2.18 cm。随后果皮颜色由青变红再变紫,最后成紫黑色,质量及大小渐增,完全成熟时单果质量为8.20 g,果实直径为2.76 cm。果实各发育阶段中还原糖是果实中最主要的营养成分。还原糖、蔗糖和可溶性固形物三者含量动态变化趋势相似,即花后30~52 d(青果—完熟),含量呈上升趋势,完熟时最高,至过熟期显著下降(P<0.05)。还原糖含量从26.58%增至56.47%,再降至53.05%,蔗糖含量从1.51%增至4.55%,再降至1.91%,可溶性固形物含量从8.80%增至17.10%,再降至15.83%。淀粉、蛋白质和粗纤维含量动态变化趋势相似,与还原糖趋势相反,即整体呈先下降再上升趋势,完熟时含量最低,过熟时显著回升(P<0.05)。花后30~52 d淀粉含量从18.92%降至13.48%,蛋白质从7.24%降至5.63%,粗纤维从5.62%降至2.60%。总氨基酸含量花后30~45 d从5.35%降至3.62%,随后回升。总多酚、总黄酮呈"降—升—降"的变化趋势,花后30 d含量最高,分别为107.63、48.03 mg·g-1,花后39 d含量最低,分别为28.75、21.05 mg·g-1。
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兔源F型多杀性巴氏杆菌双重PCR检测方法的建立
《福建农业学报 》 2021 CSCD
摘要:【目的】建立检测兔源F型多杀性巴氏杆菌的双重PCR检测方法,为兔巴氏杆菌病的诊断提供技术支持。【方法】根据多杀性巴氏杆菌kmt1基因和F型多杀性巴氏杆菌fcbD基因的保守序列分别设计了2对引物进行双重PCR扩增,对双重PCR检测方法的退火温度和混合引物浓度进行优化,并对方法的特异性、敏感性、重复性和准确性进行验证。【结果】该双重PCR方法最优反应条件为:退火温度60℃、混合引物浓度0.8μmol·L-1。该双重PCR方法能扩增出兔源F型多杀性巴氏杆菌的kmt1基因片段(260 bp)和fcbD基因片段(490 bp)、兔源A和D型多杀性巴氏杆菌的kmt1基因片段(260 bp),对兔源支气管败血波氏杆菌、肺炎克雷伯菌、大肠杆菌、金黄色葡萄球菌和阴性对照均为阴性,无交叉反应,特异性较强。该方法对兔源F型多杀性巴氏杆菌的最低检出限为1×103拷贝·μL-1,敏感性高。应用该方法对90份病死兔肺脏样品进行批内和批间重复性试验,结果均一致,重复性好。应用该双重PCR方法和已报道的多重PCR方法同时检测87份已知结果的呼吸道病死兔肺脏样品,结果显示双重PCR方法检测结果和已报道的多重PCR方法检测结果与已知结果的符合率分别为97.70%和94.25%,双重PCR方法检测结果与已报道的多重PCR方法检测结果的符合率为93.10%,双重PCR方法的准确性更高。【结论】针对多杀性巴氏杆菌kmt1基因和F型多杀性巴氏杆菌fcbD基因建立的双重PCR检测方法具有良好的特异性、敏感性、重复性和准确性,为兔源F型多杀性巴氏杆菌的快速检测提供了技术支撑。
关键词: 兔 F型多杀性巴氏杆菌 kmt1基因 fcbD基因 双重PCR检测方法
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半番鸭卵巢发育不全关键基因的筛选与差异基因表达分析
《农业生物技术学报 》 2021 北大核心 CSCD
摘要:半番鸭(Cairina moschata)为番鸭和家鸭(Anas plalyrhynchas var.domestica)的属间杂交后代,具有很强的杂种优势,但无实际种用价值.在实际生产中需要饲养半番鸭父母本,并借助于人工授精技术进行繁殖,过程繁琐且饲养管理成本高,严重限制了半番鸭生产的发展.由于半番鸭不育性状的特殊性,其与母本北京鸭卵巢组织差异表达基因的分析尚未有报道,GenBank序列数据库中相关基因的信息也相对匮乏,其不育遗传基础需进一步深入研究.转录组测序(RNA-Seq)技术不仅可用于病毒感染后组织变化分析,还可用于基因挖掘及功能注释.为了探究半番鸭卵巢发育不全相关基因与不育的分子机制,本研究利用转录组高通量测序技术筛选半番鸭和北京鸭卵巢组织分化发育相关的差异表达基因,并进行基因本体(Gene Ontology,GO)和KEGG功能注释,再利用qRT-PCR技术对差异表达基因进行验证.本次测序共获得43.84 Gb高质量测序标签(clean data)和193535条Unigene.两种类型鸭间共发现89个包括与卵巢发育、性激素合成及生殖细胞分化发育相关的差异表达基因,其中72个基因在半番鸭中上调表达,17个基因下调表达,GO功能注释差异基因富集到591个GO条目(term)中,其中显著富集的钙介导的信号传导与分化发育相关.KEGG通路(pathway)分析结果显示,差异表达基因共富集到15条信号通路中,包括与性激素合成、分泌相关的糖苷脂类生物合成-神经节系列、类固醇激素生物合成通路和酪氨酸代谢.qRT-PCR结果显示半番鸭中上调、下调基因的表达趋势与转录组测序结果一致,表明转录组测序数据较为可靠.本研究为探究半番鸭特殊的生殖系统分化机理提供理论参考依据.
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