科研产出
山羊内源性鼻内肿瘤病毒enENTV-FJ1株全基因组测序及生物信息学分析
《中国预防兽医学报 》 2020 北大核心 CSCD
摘要：为了丰富山羊内源性鼻内肿瘤病毒(enENTV)全基因组序列资源,本研究从1份患羊地方性鼻内肿瘤(ENT)病羊的肾脏中经PCR扩增了1株enENTV全基因组序列,命名为enENTV-FJ1,分别对其全基因组、5'端长末端重复序列(5'LTR)基因、gag基因、env基因及其编码的氨基酸序列进行同源性分析并构建系统进化树,对enENTV的5'LTR进行酶切位点分析,并分析该株病毒的gag、 env序列与enENTV、山羊地方性鼻内肿瘤病毒(ENTV-2)、绵羊鼻内肿瘤病毒1型(ENTV-1)等相关病毒参考株相应序列的差异性.结果 显示,enENTV-FJ1基因组结构为LTR-gag-pro-pol-env-LTR,长度为7 923 bp;全基因组同源性分析结果显示,enENTV-FJ1株与enENTV-CHN 1~enENTV-CHN6 6个参考株的同源性为95.7% ~97.3%,同源性最近;与ENTV-2参考株的同源性为87.0% ~93.2%;enENTV-FJ1的5'LTR基因序列、gag基因及其编码的氨基酸序列与enENTV参考株相应序列的同源性分别为92.8%~99.1%、92.6%~97.5%、92.2%~97.7%;enENTV-FJ1 env基因及其编码的氨基酸序列与内源性绵羊肺腺瘤病毒(enJSRV)参考株相应序列的同源性分别为93.3%~93.8%、94.3%~94.8%.全基因组进化树结果显示,enENTV-FJ1与enENTV-CHN 1~enENTV-CHN6处于同一个进化分支;5'LTR进化树结果显示,enENTV-FJ1株与enENTV-CHN2处于同一进化分支;gag基因进化树结果显示enENTV-FJ1与ENTV-CHN9处于一个小的进化分支,与enENTV-CHN6同处于一个较大的进化分支;env基因进化树结果显示,enENTV-FJ1株与ENTV-2/Spain株处于同一进化分支;所有enENTV的5'LTR区均无ENTV-2参考株所含有的Hpy188 Ⅰ、NlaIV、MowⅠ这3个酶切位点.gag基因序列分析结果显示,与enJSRV、外源ENTV-2、ENTV-1及绵羊肺腺瘤病毒(JSRV)的gag基因相比,enENTV-FJ1株在697 bp~705 bp有9个核苷酸的插入,该基因编码的氨基酸在aa229~aa232处插入3个脯氨酸.env基因编码的氨基酸结果显示,enENTV-FJ1株与ENTV-2株在aa1~aa7处插入了7个氨基酸(MFVFFRR).与外源性病毒相比,enENTV-FJ1株在跨膜蛋白(TM)胞质尾区无YXXM基序.上述结果表明,enENTV-FJ1与enENTV属于同种病毒,其5'LTR、gag基因、env基因与来自山羊的ENTV-2病毒株亲缘关系更近;其全基因组序列与外源性ENTV和JSRV的差别主要在5'LTR区、gag基因和env基因.本研究明确了enENTV-FJ1株全基因组序列,为鉴定内外源鼻内肿瘤病毒(ENTV)以及研究ENTV-2的致瘤机制奠定了基础.
关键词： 山羊 内源性山羊鼻内肿瘤病毒 全基因组测序 生物信息学分析
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栀子鲜花花水和鲜花细胞液气相和液相的成分分析
《中国农业科学 》 2020 北大核心 CSCD
摘要：[目的]通过比较栀子鲜花花水和鲜花细胞液的成分差异,为栀子鲜花花水和鲜花细胞液品质评价以及栀子花功能产品开发提供科学指导.[方法]利用顶空固相微萃取/气相色谱—质谱联用技术(HS-SPME/GC-MS)分析栀子鲜花花水和鲜花细胞液中的香气成分,通过计算机谱库和人工谱图解析,对香气成分进行定性鉴定和定量分析;利用超高效液相色谱—质谱联用技术(UPLC-ESI-QTOF-MS/MS)分析栀子鲜花花水和鲜花细胞液的化学成分,通过数据库比对,对化学成分进行定性鉴定和定量分析.[结果]栀子鲜花花水和鲜花细胞液中均含有大量的芳樟醇,相对含量分别达到63.00%和69.37%,栀子鲜花花水中检测出香气成分79种,鲜花细胞液中检测出香气成分56种,均含有醇类化合物、萜烯类化合物、酯类化合物、醛类化合物、酮类化合物、酚类化合物等8个种类的化合物.栀子鲜花花水和鲜花细胞液中醇类化合物和萜烯类化合物的相对含量总和分别达到72.00%和95.71%.栀子鲜花花水和鲜花细胞液在正、负离子模式下分别鉴定了200个、212个和46个、54个代谢成分,栀子鲜花花水和鲜花细胞液在正、负离子模式下均以生物碱类成分为主,正离子模式下生物碱类成分的相对含量分别达到47.10%和45.21%,负离子模式下分别为3.21%和13.45%.具有抗焦虑生理作用的生物碱类成分芥酸酰胺在栀子鲜花花水和鲜花细胞液中的相对含量最高.栀子鲜花花水中存在较多的抗菌、抗炎成分如双氢青蒿素、山茶皂苷元B、羟基积雪草苷以及双环孢素、塔罗霉素A等抗生素.[结论]栀子鲜花细胞液较栀子鲜花花水具有充足的头香,但持香时间短,而栀子鲜花花水的香气成分较栀子鲜花细胞液丰富,具有良好的头香和底香,持香时间长.生物碱类成分是栀子花中的主要特征性物质,可作为评价指标用于栀子鲜花花水和鲜花细胞液的品质评价.
关键词： 栀子鲜花花水 鲜花细胞液 气相质谱 液相质谱 香气成分 化学成分 生物碱
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基于15N示踪的"稻/草-食用菌-菜"循环系统氮肥利用率评价
《农业工程学报 》 2020 EI 北大核心 CSCD
摘要：氮利用效率是评价作物生产及循环农业生产效率的重要指标,该研究比较"稻/草-食用菌-菜"循环农业的氮利用效率,为该模式在南方地区推广提供依据.该研究设置"水稻-食用菌-白菜"(R模式)和"狼尾草-食用菌-白菜"(P模式)2个循环农业模式,每个循环农业模式均包括3个生产环节,分别为:15N尿素栽培水稻和狼尾草(Ⅰ环节)、15N稻草和牧草栽培平菇(Ⅱ环节)、15N菌渣栽培白菜(Ⅲ环节).结果表明,15N在稻谷的分配比例最高,为57.75%,而狼尾草第1次刈割15N分配比例最高,为58.94%.2模式氮利用效率均以Ⅰ环节最高,分别为23.44%和43.34%,其次为Ⅱ环节,Ⅲ环节最低,且P模式3个环节之间氮利用率达到显著水平;氮残留率以Ⅱ环节最高,其次为Ⅲ环节,Ⅰ环节最低.Ⅰ环节杂交狼尾草的氮利用效率高于水稻,Ⅱ环节利用杂交狼尾草栽培平菇氮利用效率也高于稻草栽培平菇,"狼尾草-食用菌-白菜"循环农业模式(P模式)的氮肥循环利用效率高于"水稻-食用菌-白菜"循环农业模式(R模式),表现为Ⅰ、Ⅱ和Ⅰ+Ⅱ+Ⅲ环节P模式氮利用效率较R模式显著提高了84.90%、69.31%和47.29%.加环后2种循环农业模式氮利用效率均得到提高,与单一水稻/狼尾草种植相比,"稻/草-食用菌-白菜"模式植株地上部15N累积量分别从63.50和112.30 mg增加至115.33和169.89 mg,氮肥利用率分别从22.29%和39.41%增加至40.48%和59.62%."狼尾草-食用菌-白菜"循环农业模式可在南方地区推广.
关键词： 氮肥 尿素肥料 水稻 狼尾草 食用菌 循环农业 15N标记技术
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杂交兰镁原卟啉Ⅸ甲酯环化酶基因的克隆与转录表达分析
《中国细胞生物学学报 》 2020 北大核心 CSCD
摘要：镁原卟啉Ⅸ甲酯环化酶被认为是与叶绿素生物合成相关的重要酶之一.为了探究其编码基因(MPEC)在杂交兰叶色变异中的功能,该研究基于杂交兰叶片转录组测序数据,采用RT-PCR技术,以杂交兰'紫妍氏'K21及其叶艺品系K21-3叶片为材料,克隆得到杂交兰MPEC基因的2个ORF序列,并对其生物信息及表达情况进行分析.杂交兰ChMPEC1和ChMPEC2基因的ORF序列长度均为1 221 bp,共编码406个氨基酸,两者存在2个差异氨基酸.生物信息学分析表明,ChMPEC1和ChMPEC2编码的蛋白质可能是一种稳定的亲水性蛋白质,属于Ferritin-like家族.进化树分析发现,杂交兰ChMPEC1和ChMPEC2与同属于兰科植物的墨兰、桃红蝴蝶兰和铁皮石斛亲缘关系较近.qPCR结果显示,在不同组织比较中,ChMPEC基因的表达情况为叶>茎>根;在不同发育时期比较中,ChMPEC基因的相对表达量从高到低依次为中苗期、小苗期和试管苗期;不同品系比较中,ChMPEC基因的相对表达量在K21中显著高于K21-3.通过叶绿素含量测定及其与ChMPEC基因相对表达量相关性分析,发现ChMPEC基因相对表达量与叶绿素a、叶绿素b及总叶绿素存在显著或极显著正相关,推测该基因参与杂交兰叶绿素的合成途径,且在K21-3叶艺形成中起一定作用.上述研究结果可为杂交兰叶艺形成机理研究提供参考依据.
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不同梨品种避雨栽培生长发育、产量与果实品质比较
《福建农业学报 》 2020 CSCD
摘要：[目的]增强南方湿热梨产区避雨栽培推广应用的针对性.[方法]以露地栽培为对照,采取定树跟踪调查方法,探讨了避雨栽培条件下,不同类型梨品种的生长发育及产量与果实品质变化趋势.[结果]与露地栽培相比,避雨栽培果实发育期与营养生长期延长、花序与花朵坐果率提高、枝叶生长弱化、果实外观改善及果实硬度降低、总糖含量增加、总酸含量减少趋势明显.易发生早期落叶的3个早熟品种的花芽比例、百花芽重、单株产量、单果质量显著或极显著增加;可溶性固形物含量除新玉无差异外,翠玉、翠冠显著提高.不易发生早期落叶的2个中熟品种花芽比例、百花芽重、单果质量显著或极显著降低或减少;单株产量晚翠无差异,黄花降低22.42%;可溶性固形物含量晚翠无差异,黄花显著降低.3个绿皮梨品种感锈程度减轻,其中翠玉感锈果率、感锈面比、花脸果率均极显著降低;翠冠、晚翠感锈果率无差异,感锈面比极显著降低,花脸果率则极显著增加.[结论]易发生早期落叶、果实抗锈的早熟品种适宜采用常年覆膜避雨栽培;易发生早期落叶、果实感锈早熟品种采用常年覆膜避雨栽培时,应配之果实套袋措施;不易发生早期落叶的中熟品种应以露地栽培为宜,若采用避雨栽培应选择生长发育中前期覆膜、采果后揭膜的阶段性避雨栽培模式.
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综合评分法优化金花茶叶提取工艺及抗氧化活性分析
《中药材 》 2020 北大核心 CSCD
摘要：目的:优化金花茶叶的超声提取工艺,并对不同生长期金花茶叶醇提物的抗氧化能力进行考察.方法:采用单因素试验结合响应面分析法,选取乙醇浓度、液料比、提取温度和提取时间为考察因素,以总黄酮、茶多酚含量和浸膏得率为综合指标,采用综合评分法进行单因素试验和4因素3水平的Box-Benhnken试验,并对不同生长期金花茶叶醇提物的清除DPPH·自由基、ABTS+自由基能力及FRAP还原力进行考察.结果:优化得到的提取工艺为:乙醇浓度60%,液料比80∶1(mL/g),提取温度55℃,提取时间30 min.不同生长期金花茶叶醇提物的抗氧化活性大小为成熟叶>老叶>幼叶.结论:优化的工艺合理可行,金花茶叶适宜采收期为成熟叶,该研究为金花茶叶作为天然抗氧化剂资源的开发提供技术参考和理论依据.
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花生品系主要农艺性状的分析与综合评价
《种子 》 2020 北大核心 CSCD
摘要：剖析花生高代品系主要农艺性状及产量关系,为高产育种提供参考依据,并对各品系进行评价筛选,为品种推广提供候选个体.运用DPS、SPSS统计软件,以11个福建花生高代品系为研究对象,对主要农艺性状及产量性状数据进行变异性分析、相关性分析、灰色关联度分析、聚类分析和主成分分析.结果表明,结果数和饱果数变异系数较大,出仁率变异系数最小,结果数和饱果数对花生产量显著正相关,灰色关联度分析也显示结果数和饱果数与产量性状的关联度最大;聚类分析结果显示,在距离阈值为18时,可将11个花生品种分为3个类群,第3类群综合性状表现良好;主成分分析结果表明,9个农艺性状和2个产量性状综合成4个主成分因子,分别为产量因子、籽仁因子、株高因子和荚果因子,累计贡献率达89.1216%,品系0945-1、0949-4和1005-3-1的综合主成分值依次排前三.0945-1和0949-4是值得推广的优良品种.在花生育种中,侧重筛选果多、果饱的单株,并兼顾其它性状可选育出高产品种.
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铁皮石斛DoSMT2基因的克隆与表达分析
《热带亚热带植物学报 》 2020 北大核心 CSCD
摘要：为了解SMT2基因在铁皮石斛(Dendrobium officinale)甾醇代谢过程中的作用,利用RACE技术克隆到1个DoSMT2基因,开放阅读框为1089 bp,编码362个氨基酸,DoSMT2相对分子量为40.345 kD,理论等电点为8.13,属于稳定的亲水性蛋白.经BLAST P检索,DoSMT2蛋白属于AdoMet-MTases超级家族,含有4个S-腺苷蛋氨酸结合位点、1个甲基转移酶保守结构域和1个甾醇甲基转移酶C末端保守结构域.系统进化分析表明,DoSMT2与深圳拟兰(Apostasia shenzhenica)的SMT2亲缘关系最近,确定其属于SMT2家族.qRT-PCR分析结果表明,DoSMT2基因在茎和叶都能表达,10月份的表达量最高,叶片的表达量显著高于茎,推断叶片的甾醇代谢比茎活跃.构建了pET-29a-DoSMT2原核表达载体,并转化大肠杆菌BL21(DE3),IPTG诱导表达出预期大小的蛋白.这为铁皮石斛DoSMT2的甲基化机制及甾醇化合物代谢研究奠定基础.
关键词： 铁皮石斛 甾醇C-24甲基转移酶 原核表达 荧光定量PCR
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