利用基因芯片开展广西麻鸡2个群体亲缘关系的遗传分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 屠云洁

作者： 屠云洁;唐燕飞;蒋华莲;刘一帆;单艳菊;姬改革;巨晓军;章明;邹剑敏;束婧婷

作者机构：

关键词： 鸡;亲缘关系;基因芯片;遗传距离;聚类分析

期刊名称： 中国畜牧杂志

ISSN： 0258-7033

年卷期： 2021 年 57 卷 008 期

页码： 143-146

收录情况： 北大核心

摘要： 本实验旨在揭示广西麻鸡2个群体里当鸡(MA)和灵山香鸡(MB)之间的遗传距离和亲缘关系,为培育市场需求的优质麻鸡配套系提供参考和帮助.实验从MA和MB群体中分别随机抽取25只鸡(公鸡13只,母鸡12只)的血样,利用"京芯一号"鸡55K芯片技术对2个群体的亲缘关系进行遗传分析.通过主成分分析(Principal Component Analysis,PCA),2个群体的个体随机聚在一起,没有出现明显分别聚类的现象.基于状态同源(Idengtical By State,IBS)和G矩阵(二维树状数组)表明2个群体大多数个体间亲缘关系较远.使用邻接法(Neighbor-Joining,NJ),基于IBS遗传距离分析结果对2个群体样本进行聚类,结果表明MA和MB分别聚为一大类,说明2个群体遗传距离较远,群体间亲缘关系相对较远.2个群体基于长纯合片段(Runs of Homozygosity,ROH)的平均近交系数为0.0225,MA和MB群体近交系数分别为0.0189和0.0262,近交系数较低.

分类号： S831.2

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