嘉积鸭APOC3基因多态性与生长性状关联分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 谢攀攀

作者： 谢攀攀;徐铁山;顾丽红;张丽

作者机构：

关键词： 嘉积鸭;APOC3基因;生长性状;单核苷酸多态性;关联分析

期刊名称： 西南农业学报

ISSN： 1001-4829

年卷期： 2025 年 38 卷 004 期

页码： 855-864

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： [目的]筛查嘉积鸭载脂蛋白C3(APOC3)基因潜在的单核苷酸多态性(SNPs)位点,并分析其与生长性状的关联性,为嘉积鸭分子选育提供理论支撑.[方法]以嘉积鸭为研究对象,利用PCR扩增和直接测序法检测APOC3基因SNPs,并进行遗传多样性分析;采用SPSS对不同多态位点所对应的基因型与体尺指标进行相关性分析;利用HaploView软件分析APOC3基因SNPs的连锁不平衡和单倍型;通过NAfold WebServer软件预测不同基因型的mRNA二级结构.[结果]在嘉积鸭的APOC3基因中共发现11个SNPs,其中4个位于5'UTR,1个位于2号外显子中且为同义突变,其他6个为内含子突变,均存在3种基因型.其中,仅有3个SNPs 即 g.6555762G>A、g.6555842G>A、g.6555964C>T 符合 Hardy-Weinberg 平衡(P>0.05).SNPs 多态位点与体重体尺关联分析结果表明,具有显著关联(P<0.05)的是2个SNPs位点(g.6555465G>A、g.6555516G>A)与龙骨长,1个SNP位点(g.6555516G>A)与胫长,2 个 SNPs 位点(g.6555632C>T、g.6555640C>A)与体重,2 个 SNPs 位点(g.6555762G>A、g.6555842G>A)与胸深,1 个 SNPs 位点(g.6555842G>A)与体斜长,1 个 SNPs 位点(g.6555964C>T)与胫围.g.6555513C>T 和 g.6555516G>A存在强连锁关系,形成3种单倍型,即H1(CA)、H2(CG)、H3(TG).g.6555465G>A和g.6555494G>A位点的突变导致mRNA最小自由能升高,降低了 mRNA二级结构稳定性,其余3个位点的突变降低了最小自由能,增加了二级结构稳定性.[结论]嘉积鸭APOC3 基因的 7 个 SNPs(g.6555465G>A、g.6555516G>A、g.6555632C>T、g.6555640C>A、g.6555762G>A、g.6555964C>T、g.6555842G>A)对体重、体斜长等生长指标具有显著影响,可作为嘉积鸭选育的候选标记.

分类号： S858.32

  • 相关文献

[1]IGF-1R基因SNPs检测及其与水貂生长性状的关联分析. 宋姗姗,刘宗岳,丛波,刘琳玲,宋兴超,彭英华. 2019

[2]大口黑鲈HSC70-1基因多态性及其双倍型与生长性状的关联分析. 李胜杰,樊佳佳,姜鹏,白俊杰,孙建国,吴建开,费志平. 2018

[3]大口黑鲈组织蛋白酶B基因SNP筛选及其与生长性状关联分析. 李胜杰,周春龙,白俊杰,吴建开,樊佳佳,费志平,孙建国,马冬梅. 2018

[4]无角牦牛Hesx1基因多态性及其与生长性状的关联分析. 张浩,王宏博,马武,贾聪俊,马晓明,吴晓云,褚敏,阎萍,成述儒,梁春年. 2019

[5]利用RNA-Seq技术分析草鱼生长性状相关基因和SNP标记. 孙雪,李胜杰,姜鹏,杜金星,周家辉,白俊杰. 2021

[6]大口黑鲈NPY基因多态性及与生长的关联分析. 李胜杰,刘浩,白俊杰,吴建开,马冬梅,费志平,樊佳佳,孙建国. 2018

[7]猪PIT-1基因多态性与生长性状的关联分析. 许金根,曹祖兵,王立克,顾有方,李升和,李庆岗. 2017

[8]沃金黑牛GPR41基因多态性及其与不同阶段生长性状的相关性分析. 刘宇,肖成,金海国,杨少滢,缪立生,沈宏旭,曹阳. 2022

[9]草鱼柠檬酸合酶基因SNP筛选及与生长性状的关联分析. 樊佳佳,刘小献,白俊杰,于凌云. 2014

[10]尼罗罗非鱼MYF5基因SNP位点筛选及其与不同群体生长性状的关联分析. 佟延南,高风英,刘志刚,王淼,曹建萌,衣萌萌,可小丽,卢迈新,朱海. 2023

[11]牙鲆mstn基因SNPs位点多态性与生长性状的关联分析. 李兵部,王桂兴,张晓彦,刘玉峰,何忠伟,曹巍,任建功,任玉芹,张祎桐,伞利择,王玉芬,侯吉伦. 2024

[12]玉米叶向值的全基因组关联分析. 彭勃,赵晓雷,王奕,袁文娅,李春辉,李永祥,张登峰,石云素,宋燕春,王天宇,黎裕. 2020

[13]美洲水貂刺鼠信号蛋白基因SNPs检测及其与毛色表型的关联分析. 宋兴超,徐超,刘宗岳,岳志刚,丛波,刘琳玲,杨福合. 2016

[14]猪NNAT基因印记鉴定及单核苷酸多态性分析. 乔木,吴俊静,彭先文,梅书棋. 2021

[15]绵羊D1x3基因启动子活性及其多态性与羊毛品质性状的关联. 裴文宇,云杰,荣恩光,杨华,王志鹏,王守志,李辉,王宁. 2013

[16]单核苷酸多态性在茶树中应用的研究进展. 陈丝,郭燕,杨春,李燕. 2018

[17]植物中单核苷酸多态性的分布及其应用. 陈吉宝,赵丽英,褚学英,昌小平,景瑞莲. 2009

[18]硒都黑猪NT5C1A基因组织表达特征及遗传多态性分析. 乔木,武华玉,彭兆坤,吴俊静,梅书棋,彭先文. 2022

[19]小麦果聚糖合成酶基因6-SFT-D多态性及其与6-SFT-A2的累加效应. 岳爱琴,李昂,毛新国,昌小平,柳玉平,李润植,景蕊莲. 2016

[20]绵羊Dlx3基因启动子活性及其多态性与羊毛品质性状的关联. 裴文宇,云杰,荣恩光,杨华,王志鹏. 2013

作者其他论文 更多>>

微信小程序