越冬期体色变异红罗非鱼差异表达miRNA的鉴定

文献类型: 中文期刊

第一作者: 王兰梅

作者: 王兰梅;朱文彬;傅建军;罗明坤;董在杰

作者机构:

关键词: 红罗非鱼;越冬;体色变黑;microRNA (miRNA)

期刊名称: 水产学报

ISSN: 1000-0615

年卷期: 2023 年 004 期

页码: 16-26

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 为了探究红罗非鱼越冬期体色变异的分子机制,实验构建了其2种体色(正常粉红体色和变黑体色)皮肤组织的小RNA文库,每组4个重复,组装后平均每组分别获得12 190 544和11 891 890条过滤后的读长(clean reads),获得miRNA成熟序列669个,其中337个是已知的miRNAs。鉴定出越冬期变黑体色相对于正常粉红体色鱼的差异表达miRNAs 26个,其中上调11个,下调15个,且12个为已知的miRNAs,可能在红罗非鱼越冬期体色变异过程中发挥重要作用。富集分析发现了大量代谢和体色调控相关的通路。研究表明,红罗非鱼越冬期的体色变异可能是色素细胞的增殖和迁移形成的,与代谢相关的调控通路在其中发挥重要作用,为解析红罗非鱼越冬期体色变异的机制奠定了基础。

分类号: S917.4

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