菊芋果聚糖合成关键基因1-SST克隆及序列分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 高洁铭

作者： 高洁铭;杨世鹏;王丽慧;张亚琦;王艳萍;孙雪梅

作者机构：

关键词： 菊芋(Helianthustuberosus L.);1-SST;基因克隆;生物信息学分析

期刊名称： 分子植物育种

ISSN： 1672-416X

年卷期： 2020 年 18 卷 024 期

页码： 8039-8046

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 果聚糖是菊芋的主要贮藏物质,其代谢与产量形成和逆境适应性密切相关.为了解菊芋果聚糖合成代谢的机制,本研究以'青芋1号'为研究对象,利用同源克隆方法,对果聚糖合成关键基因1-SST克隆及序列分析.结果表明,1-SST基因全长为3 925 bp,CDS大小为1 890 bp,由5个内含子和6个外显子组成.经生物信息学分析,预测1-SST蛋白分子量70 934.40 Da,等电点5.10,有两个属于糖基水解酶32家族的保守区,属于亲水性蛋白,以延伸结构(24.48%)和无规则卷曲(56.76%)为主要二级结构,在质膜外行使功能.系统进化分析表明,菊芋1-sST基因与向日葵遗传距离最近,与龙舌兰等不同科不同属的植物进化距离较远.本研究基于对菊芋中调控果聚糖合成代谢1-SST基因的克隆与生物信息学分析,为高等植物果聚糖代谢途径研究奠定一定的理论基础.

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