文献类型： 中文期刊
第一作者： 王玉臣
作者： 王玉臣;谭玉梅;陈丽;刘建魁;刘永翔;刘作易
作者机构：
关键词： 赤散囊菌;促分裂原活化蛋白激酶(MAPK);MAPK激酶(MAPKK);MAPK激酶激酶(MAPKKK)
期刊名称： 菌物学报
ISSN： 1672-6472
年卷期： 2016 年 35 卷 09 期
页码： 1117-1129
收录情况： 北大核心 ; CSCD
摘要： 本研究以赤散囊菌Eurotium rubrum全基因组序列为对象,利用HMMER软件构建隐马尔可夫模型(hidden markov models,HMM)结合BLAST的方法鉴定了促分裂原活化蛋白激酶(mitogen-activated protein kinase,MAPK)超家族。通过构建系统发育树对鉴定蛋白进行分析,并利用MEME软件进行了保守性基序的预测及活性位点注释。分析结果表明,赤散囊菌基因组包含了4个MAPK蛋白,分别属于Hog1-type、Mpk C-type、Slt2-type和Fus3/Kss1-type类型;3个MAPK kinase(MAPKK)蛋白,分别属于MKK1-type、Pbs2-type和Ste7-type类型;3个MAPK kinase kinase(MAPKKK)蛋白,分别属于BCK1-type、Ste11-type和Ssk22-type类型。保守性基序分析及注释结果表明,MAPKs超家族蛋白都包含了蛋白激酶活性位点"-D[L/I/V]K-"以及保守性的ATP-binding标签序列。MAPK与MAPKK蛋白分别包含了"-Tx Y-"和"-SD[I/V]WS-"磷酸化位点,且MAPK蛋白还包含一个保守性的common docking基序(CD motif),而MAPKKK蛋白则包含了一个功能不明的保守性基序,其一致性序列为"-GTPYWMAPEV-"。研究结果为揭示MAPKs信号途径在赤散囊菌中参与调控的生物学过程奠定了基础。
分类号： Q949.32
- 相关文献
[1]南方根结线虫促分裂原活化蛋白激酶(MAPK)基因的RNAi效应分析. 陈国华,肖罗,张双庆,杨宇红,谢丙炎. 2008
作者其他论文 更多>>
-
不同基质配方处理对蓝莓果实产量及品质的影响
作者：裴嘉博;刘辉;马振华;钟林炳;骆慧枫;刘禹姗;邓宇;黄康康;张琛;陈丽;高国忠;郗笃隽
关键词：蓝莓;基质;果实品质
-
甜菜MAPK蛋白家族及尾孢菌侵染的转录表现分析
作者：马子淞;赵春雷;王希;李彦丽;贾海伦;丁广洲;陈丽
关键词：丝裂原活化蛋白激酶(MAPK);甜菜;生物信息学分析
-
光质对蓝莓果实品质的影响
作者：裴嘉博;刘辉;钟林炳;骆慧枫;刘禹姗;阮若昕;张琛;陈丽;郗笃隽
关键词：蓝莓;红光;蓝光;果实品质
-
2021-2023年京津冀蔬菜产销监测数据集
作者：陈丽;王剑;赵安平;王晓东;刘娟;王诗睿;宁晓涵;王增飞;杨唯佳
关键词：蔬菜;产销监测;京津冀地区
-
基于非靶向代谢组学的红曲菌发酵夏秋茶低分子成分分析
作者：贺圣凌;周罗娜;宋诗颖;赵兴丽;谭玉梅
关键词：红曲菌;夏秋茶;气相色谱-质谱;代谢组学;非靶向;差异代谢物;代谢通路
-
水稻浅覆土旱直播栽培技术
作者：孙建昌;马洪文;马静;陈丽;刘炜
关键词：水稻;浅覆土;旱直播
-
磷酸化和乙酰化对丙酮酸激酶活性及结构的影响
作者：黄小兰;陈丽;任驰;摆玉蔷;吴赛赛;侯成立;李欣;张德权
关键词：丙酮酸激酶;磷酸化;乙酰化;活性;结构
