猪T细胞受体β链基因的克隆及生物信息学分析

文献类型: 中文期刊

第一作者: 李玩生

作者: 李玩生;刘磊;冯海燕;房永祥;景志忠

作者机构:

关键词: 猪TCR-β链基因;基因克隆;生物信息学;结构预测

期刊名称: 甘肃农业大学学报

ISSN: 1003-4315

年卷期: 2010 年 21 卷 03 期

页码: 1-6+13

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 以GenBank上登载的猪的T细胞受体β(pTCR-β)基因为参考序列,用RT-PCR法从猪的外周血淋巴细胞中克隆了TCR-β链基因,并进行生物信息学分析.结果表明:pTCR-β基因含有一个完整的开放阅读框架(ORF),大小为849bp,编码283个氨基酸,且含有一段27个氨基酸的信号肽序列,与参考序列相比,在核苷酸序列上的同源性为80.4%,在氨基酸序列上的同源性为70.3%;生物信息学结构预测发现2个结构域,一个为IG结构域,由第32-138位共107个氨基酸残基组成;另一个为IG-LIKE结构域,由第164-211位共48个氨基酸残基组成.

分类号: S828

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