基于重测序的大豆新品种齐黄34的全基因组变异挖掘

文献类型： 中文期刊

第一作者： 张彦威

作者： 张彦威;李伟;张礼凤;王彩洁;戴海英;徐冉

作者机构：

关键词： 全基因组重测序;单核苷酸多态;小片段插入缺失;结构变异;基因变异

期刊名称： 中国油料作物学报

ISSN： 1007-9084

年卷期： 2016 年 38 卷 02 期

页码： 150-158

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 为全面揭示大豆优良品种和重要亲本的全基因组突变类型,采用高通量重测序技术,对大豆品种齐黄34进行全基因组重测序,测序深度13×,共检测到1 519 494个单核苷酸多态位点,357 549个小片段插入缺失位点,4 506个结构变异;这些变异共导致了17 748基因变异;大量光周期相关的重要基因发生突变,其中包括CRYPTOCHROME 2、GIGANTEA、Timing of CAB expression 1、E1、PHYTOCHROME A、Flowering Locus T、CONSTANS、Terminal Flower like等,齐黄34为E1基因型。本研究为分子标记辅助选择提供了重要的标记资源。

分类号： S565.1

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