合浦珠母贝基因组微卫星富集文库的构建与分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 油九菊

作者： 油九菊;范嗣刚;黄桂菊;郝博飞;陈飞飞;喻达辉

作者机构：

关键词： 合浦珠母贝(Pinctada fucata);微卫星;磁珠富集

期刊名称： 海洋科学

ISSN： 1000-3096

年卷期： 2015 年 10 期

页码： 8-14

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 采用生物素标记的(AC)_(15)探针和磁珠富集法构建合浦珠母贝(Pinctada fucata)基因组DNA微卫星富集文库。随机挑选2097个克隆进行筛选,得到483个候选克隆(23.03%),对其中135个阳性克隆测序分析发现122个克隆含有微卫星重复单元(90.37%)。进一步通过序列比对,最终得到65个具有特异微卫星序列的阳性克隆(53.28%),其中包含85个微卫星DNA结构域,其中完美型(perfect)70个,占82.36%;非完美型(imperfect)7个,占8.24%;混合型(compound)8个,占9.41%,重复次数主要分布在5~20(95.74%),平均重复次数为7.83,(AC/GT)n重复所占比例最高(75.53%)。基于微卫星两端的侧翼序列,利用Primer Premier 5.0设计引物,获得11对具有多态性的微卫星引物。本研究为开展合浦珠母贝分子育种及资源评价分析提供了基础资料。

分类号： S917.4

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