花生HSP 20基因家族鉴定及其表达特性分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 姜焕焕

作者： 姜焕焕;张嘉敏;何洪活;李丽梅;吴倩盈;黄晓;王通

作者机构：

关键词： 花生;HSP 20基因家族;生物信息学;表达特性

期刊名称： 肇庆学院学报

ISSN： 1009-8445

年卷期： 2022 年 05 期

页码： 6-14

摘要： HSP20是一类小分子热激蛋白，在植物抵御逆境胁迫中发挥重要作用.本研究借助花生基因组数据库，通过隐马尔可夫（Hiddne Markov Model,HMM）搜索野生种花生（Arachis duranensis）和（Arachis ipaensis）蛋白质数据库，鉴定出AdHSP 20和AiHSP 20基因各27个，基因长度为946～1 103 bp，不均匀分布在花生9条染色体上.进化树分析显示，这些基因分为11个亚家族.通过对基因结构和保守序列分析表明该基因家族高度保守.表达分析发现，2个野生种花生中各有5个基因在各组织中高表达，大部分基因在果针入土期开始大量表达，具有组织表达特异性，存在多个激素及逆境胁迫相关的顺式作用元件，预示着该基因家族参与花生逆境胁迫响应.

分类号： S565.2

  • 相关文献

[1]甘蓝型油菜GPDH基因克隆、表达分析及植物过表达载体构建. 张超,付三雄,周小婴,唐容,黄莎,杨克相,戚存扣. 2019

[2]普通小麦祖先种类TaNAC2a基因的鉴定分析和表达模式研究. 张凤洁,李雪垠,高世庆,冯变娥,刘婷婷,唐益苗,赵昌平,王爱萍. 2014

[3]甘蔗ATP结合蛋白基因克隆及其干旱胁迫下的表达特性分析. 蒋胜理,黄诚梅,邓智年,吴凯朝,徐林,罗海斌,陆珍,魏源文. 2017

[4]花生AhSOS2基因的克隆及功能初探. 张国嘉,侯蕾,王庆国,徐建第,李臻,刘晓,戴绍军,刘炜. 2014

[5]花生AhNCED1基因的克隆、序列分析与载体构建. 王云云,孙全喜,王秀贞,唐月异,吴琪,张青云,曹广英,祁雪,张君,王传堂. 2017

[6]‘航花2号’的Δ~(12)脂肪酸脱氢酶(FAD2)基因的生物信息学分析. 温世杰,李杏瑜,洪彦彬,李少雄,周桂元,陈小平,梁炫强. 2017

[7]‘航花2号’的Δ~(12)脂肪酸脱氢酶(FAD2)基因的生物信息学分析. 温世杰,李杏瑜,洪彦彬,李少雄,周桂元,陈小平,梁炫强. 2017

[8]花生赤霉素3-β-双加氧酶(AhGA3ox)基因家族的全基因组鉴定及表达分析. 李海芬,鲁清,刘浩,温世杰,王润风,黄璐,陈小平,洪彦彬,梁炫强. 2024

[9]花生黄曲霉抗性与糖原合成酶激酶-3的关系. 严海燕,宗成志,包文志,单世华. 2011

[10]花生不同部位CEM1基因表达特征分析. 尹红,张廷婷,王春玮,庄伟建,单世华. 2013

[11]花生AT-hook家族基因的生物信息学分析. 胡冬秀,刘浩,梁炫强,吴自明,方加海. 2021

[12]花生紫色酸性磷酸酶基因家族的鉴定及表达分析. 杜普旋,刘浩,胡冬秀,陈小平,洪彦彬,李友国. 2022

[13]花生CEM1基因的克隆及表达载体构建. 张浩,庄伟建,张廷婷,王春玮,尹红,闫彩霞,郑奕雄,单世华. 2013

[14]基于全基因组水平的花生FAR1转录因子家族分析. 赵小波,李春娟,孙全喜,王奇,牟艺菲,王娟,苑翠玲,姜常松,单世华. 2024

[15]猪脂肪甘油酸脂酶(ATGL)基因的表达特性分析. 杨红文,粟朝芝,王德凤. 2012

[16]地衣芽胞杆菌碱性蛋白酶基因克隆与表达特性. 许发芝,李吕木,徐子伟,张志才. 2011

[17]甜菜夜蛾SeKr-h1基因分子表达特性及其对保幼激素类似物的响应. 赵静,谭永安,房菊,朱友雯,姜义平,肖留斌. 2021

[18]瓦氏雅罗鱼SLC26A1基因的克隆及表达特性分析. 孙博,常玉梅,张立民,梁利群. 2020

[19]尖孢镰刀菌古巴专化型4号生理小种的磷酸化应激诱导蛋白1(FoSTIP1)基因的克隆及表达分析. 齐兴柱,汪军,刘磊. 2019

[20]甘薯查尔酮异构酶基因IbCHI的克隆和表达特性. 饶莉萍,苏文瑾,刘意,宋天晓,SOVIGUIDI Deka Reine Judess,张文英,杨新笋. 2020

作者其他论文 更多>>

微信小程序