三株猪2型圆环病毒甘肃分离株的全基因组序列分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 马友记

作者： 马友记;柳纪省;李志勇;殷相平;杨彬;李发弟;张利

作者机构：

关键词： 猪2型圆环病毒;基因组;ORF1;ORF2;序列分析

期刊名称： 甘肃农业大学学报

ISSN： 1003-4315

年卷期： 2007 年 42 卷 03 期

页码： 1-6

收录情况： CSCD

摘要： 根据GenBank中发表的猪2型圆环病毒(PCV2)全基因组序列,设计合成了2对引物,采用PCR方法对来自甘肃不同猪场的3份病料中的PCV2进行基因的扩增、克隆和测序,得到全基因组长度为1 768 bp的PCV2Ww株(登录号DQ322701)以及全基因组长度为1 767 bp的PCV2 LZ株和TS株(登录号DQ363860和DQ355153).应用DNAstar软件序列分析可得,3个分离株全基因组与国内外参考毒株核苷酸序列同源性在94.8%~99.4%,3个分离株之间的核苷酸序列同源性为96.4%~99.4%;PCV2分离株与PCV1分离株核苷酸序列同源性为69.0%~70.0%;ORF1和ORF2所编码的氨基酸序列与国内外PCV2毒株比较,同源性也很高,分别为99.0%~99.4%和92.7%~98.7%.进化树分析表明,PCV2分离毒株在进化上存在地域上的相关性.

分类号： S852.65

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