浙南忍冬属药材rbcL基因序列分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 李小侠

作者： 李小侠;陶正明;吴志刚;林新春;范传颍

作者机构：

关键词： 忍冬属;rbcL;序列分析;聚类分析

期刊名称： 温州医学院学报

ISSN： 1000-2138

年卷期： 2012 年 06 期

页码： 549-552

摘要： 目的:分析浙南忍冬属药用植物叶绿体rbcL基因序列,探讨其差异。方法:Primer Premier5.0设计引物,用于rbcL基因PCR扩增,ClustalX1.83进行序列全比对。MEGA 4.0分析转换值、颠换值等;以七子花Heptacodium miconioides为外类群,邻接法(Neighbor-Joining,NJ)和最大简约法(Maximun Parsimony,MP)进行聚类分析(models:p-distance);自展法(Bootstrap)检验各分支可信度。结果:5种忍冬属药材rbcL基因片段长度在1 143～1 167 bp之间,手工校正后长度为1 137 bp,保守位点1 126个,变异位点11个,简约信息位点6个,碱基转换和颠换分别为3和2,比值为1.6;MP和NJ两种方法所得结果几乎一致,均将5种忍冬属药材分为两大支,黄褐毛忍冬与忍冬为第一大支,红腺忍冬、华南忍冬和灰毡毛忍冬为第二大支。结论:rbcL基因能够从分子水平揭示5种忍冬属药材的差异,为忍冬属药材鉴定以及系统发育提供重要参考依据。

分类号： S567.79

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