基于DPO引物检测猪流行性腹泻病毒荧光定量RT-PCR方法的建立及初步应用

文献类型: 中文期刊

第一作者: 王以欣

作者: 王以欣;王紫薇;汉武娇;王丽;姜艳平;崔文;周晗;乔薪瑗;唐丽杰;李一经;徐义刚

作者机构:

关键词: 猪流行性腹泻病毒;DPO引物;荧光定量RT-PCR

期刊名称: 中国预防兽医学报

ISSN: 1008-0589

年卷期: 2019 年 07 期

页码: 710-715

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 为建立快速、准确检测猪流行性腹泻病毒(PEDV)的方法,本研究以PEDV的N基因为靶基因,基于双启动寡核苷酸引物(DPO),经过条件优化,建立了检测PEDV的荧光定量RT-PCR方法。结果显示,DPO引物的有效退火温度范围较宽(45℃~65℃);在测试的10种病毒中仅PEDV为阳性扩增结果,其余病毒为阴性结果,特异性较强;对PEDV质粒标准品的检测限可达1.64×10~1拷贝/μL,敏感性较高;组内、组间重复性结果的变异系数均小于1%,重复性较好。利用该方法对采集的272份临床仔猪腹泻样品(粪便、小肠组织)进行检测,结果显示,共检出PEDV阳性样品39份,阳性率为14.34%,与常规RT-PCR方法检测结果的阳性符合率为92.31%;本研究建立方法检测的阳性样品经PEDV N基因测序鉴定,确实均为PEDV阳性样品。本研究建立的基于DPO引物检测PEDV的荧光定量RT-PCR方法为PEDV的准确检测和流行病学调查提供技术支持。

分类号: S852.651

  • 相关文献

[1]猪流行性腹泻病毒SYBRⅠ实时荧光定量RT-PCR检测方法的建立. 修金生,周伦江,陈如敬,王隆柏,陈小权. 2012

[2]猪流行性腹泻病毒实时荧光定量RT-PCR检测方法的建立与应用. 沈学怀,潘孝成,巩雅静,张丹俊,赵瑞宏,胡小苗,戴银,侯红艳,周学利,朱传民. 2014

[3]TaqMan荧光定量PCR检测猪流行性腹泻病毒方法的建立与初步应用. 刘邓,袁秀芳,冉多良,徐丽华,牛登元,王朝文,王一成. 2010

[4]猪IGF-Ⅰ基因荧光定量PCR标准曲线的建立. 肖书奇,张嘉保,张树敏,赵志辉,刘保国,李爽,戴立胜,赵中利,高妍,李毅. 2006

[5]莱芜猪和杜洛克猪肌肉H-FABP基因表达量与肌内脂肪和脂肪酸含量关联分析. 呼红梅,王继英,郭建凤,张印,沈彦锋,武英. 2010

[6]贝类中诺如病毒SYBR Green I实时定量RT-PCR检测方法研究. 苏来金,周德庆,马丽萍,曹慧慧. 2009

[7]雏鸡感染鸡白痢沙门菌后禽β-防御素6和鸡Toll样受体15在肠道转录与定位研究. 王燕,周秀红,祁克宗,涂健,刘红梅,潘孝成. 2014

[8]TCDCA对AA大鼠滑膜组织糖皮质激素受体基因表达的影响. 毛伟,钱英红,关红,何秀玲,刘博. 2017

[9]应用灭光定量RT-PCR方法检测PRRSV变异株在仔猪体内动态分布. 荣福龙,刘永刚,孙广力,王淑杰,王洪峰,石文达,李丽琴,徐明明,孙刚,田志军,蔡雪辉. 2010

[10]TLR2、4/MyD88通路相关分子mRNA在急性结肠炎小鼠结肠组织中的表达及意义. 刘丽琼,聂奎,余姣,廖鑫凯. 2012

[11]蚯蚓金属硫蛋白定量PCR检测方法及其分子诊断. 陈春,周启星. 2011

[12]新型鸭呼肠孤病毒一步法TaqMan-MGB荧光定量RT-PCR检测方法的建立与应用. 云涛,华炯钢,叶伟成,倪征,陈柳,张存. 2020

[13]荧光定量RT-PCR检测滩羊H-FABP基因表达规律及与肌内脂肪相关性研究. 岳彩娟,额尔和花,柴君秀,谢秀兰,李颖康. 2017

[14]改良CTAB方法提取果树不同组织的RNA. 关玲,赵密珍,王庆莲,吴伟民,钱亚明,巫建华. 2018

[15]兔出血症病毒2型TaqMan探针荧光定量RT-PCR检测方法的建立及应用. 陈萌萌,仇汝龙,范志宇,胡波,宋艳华,魏后军,朱伟峰,徐为中,王芳. 2021

[16]基于P18蛋白基因的新型鸭呼肠孤病毒荧光定量RT-PCR检测方法的建立. 沈丽雅,潘群兴,卢凤英,董永毅,张敬峰,吴坤,刘青涛,姜平,张小飞. 2021

[17]盖塔病毒TaqMan探针荧光定量RT-PCR检测方法的建立. 朱翔宇,鲁荣光,胡博,蔡熙姮,刘昊,史宁. 2020

[18]麦蚜Cdc42基因的准确组织定位和定量分析方法研究. 陈巨莲,程登发,孙京瑞. 2010

[19]鉴别RHDV与RHDV2荧光定量RT-PCR检测方法的建立与应用. 肖跃强,孙培姣,周迎春,陈萌萌,崔平,杨慧,于雪,于新友,王芳,沈志强. 2021

[20]H9N2亚型禽流感病毒冷适应株的培育及SPF鸡胚感染后的免疫应答分析. 马鑫鑫,崔宁,历成海,黄庆华,梁立生,杨少华,赵孝民,许传田. 2019

作者其他论文 更多>>