雷蒙德氏棉HSP70基因家族的进化分析及其同源基因在陆地棉中的表达分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 张毓婷

作者： 张毓婷;王敏华;陈家栋;戎均康;丁明全

作者机构：

关键词： 棉纤维;HSP70家族;深度测序;基因结构;系统进化分析

期刊名称： 遗传

ISSN： 0253-9772

年卷期： 2014 年 36 卷 09 期

页码： 921-933

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 热激蛋白70家族(HSP70)是一类在植物中高度保守的分子伴侣蛋白,在细胞中协助蛋白质正确折叠。文章利用隐马可链夫模型(HMM)在雷蒙德氏棉(Gossypium raimondii L.)全基因组范围内进行HSP70基因家族成员进化分析,共得到30个HSP70家族成员。利用生物信息学对雷蒙德氏棉HSP70基因的结构、染色体分布、基因倍增模式以及系统进化进行分析,结果表明,HSP70基因家族根据亚细胞定位结果可分为不同的基因亚家族,各亚家族中HSP70基因具有相对保守的基因结构;染色体片段重复和串联重复是雷蒙德氏棉HSP70基因家族扩增的主要方式。通过对不同物种的HSP70基因家族进行系统进化分析可知,HSP70亚组的分化发生在单细胞植物形成前,且细胞质型HSP70成员大量扩增。比较陆地棉棉纤维发育不同时期的深度测序表达谱,发现HSP70基因可能参与棉纤维的生长发育。本研究结果有助于了解棉属植物HSP70基因家族的功能,以期为深入研究棉纤维发育过程中的分子调控机理提供基础。

分类号： S562

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