山桐子SRAP-PCR反应体系的优化及有效引物筛选

文献类型： 中文期刊

第一作者： 严莉

作者： 严莉;仝铸;苏春莉;何秀娟;肖翠;王泽琼;周明芹;袁龙义;邱文明;孙中海

作者机构：

关键词： 山桐子;SRAP-PCR;引物筛选;体系优化

期刊名称： 分子植物育种

ISSN： 1672-416X

年卷期： 2025 年 23 卷 016 期

页码： 5388-5394

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 为建立适用于山桐子（Idesia polycarpa Maxim.）的SRAP-PCR反应体系，用于山桐子资源分析和鉴定，本研究以山桐子幼嫩叶片DNA为材料，采用L16（4～5）正交试验设计，对影响山桐子SRAP-PCR反应体系的主要影响因素Mg2+、d NTPs和引物浓度以及Taq DNA聚合酶和模板DNA用量进行优化。结果表明：山桐子SRAP-PCR最优反应体系中模板DNA为30ng、Taq DNA聚合酶用量为1.5U、dNTPs浓度为0.25mmol/L、引物浓度为0.5μmol/L、Mg2+浓度为3 mmol/L、1×PCR buffer，总体系20μL。各因素对山桐子SRAP-PCR扩增效果影响从大到小依次为：Taq DNA聚合酶用量、Mg2+浓度、引物浓度、模板DNA浓度、dNTPs浓度。采用优化后的体系对267组SRAP引物进行筛选，其中220对引物组合可扩增出目的条带（引物有效性82.39%）;157对引物组合能够扩增出清晰且多态性较高的条带。利用其中6对引物组合对24份山桐子资源进行了遗传分析，聚类结果客观反映了这些资源的地理分布和亲缘关系。以上结果表明本研究优化的山桐子SRAP-PCR反应体系稳定、可靠，可用于山桐子遗传资源研究等应用。

分类号： S792.99

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