枸杞木虱ORCO基因及其编码蛋白的生物信息学分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 祁全梅

作者： 祁全梅;李秋荣;郭青云

作者机构：

关键词： 枸杞木虱;非典型气味受体基因;嗅觉;生物信息学

期刊名称： 河北农业科学

ISSN： 1008-1631

年卷期： 2021 年 001 期

页码： 96-102,109

摘要： 枸杞木虱是枸杞的重要害虫之一,利用生物信息学软件对该虫非典型气味受体（ORCO）基因进行分析,可为进一步研究验证枸杞木虱ORCO基因的嗅觉相关功能提供理论基础。对枸杞木虱ORCO基因及其编码蛋白进行理化性质、序列特性、结构预测、进化关系等生物信息学分析。结果表明:枸杞木虱ORCO基因编码450个氨基酸,相对分子质量51.25 KD,等电点为6.32;亚细胞主要定位于其他细胞器,不属于分泌蛋白,不存在信号肽;有7个跨膜结构,Pfam:7tm6结构域和Pfam:7tm7结构域各1个;平均疏水性为0.254,属于疏水性蛋白;编码蛋白的二级结构中,α螺旋、直链延伸、β转角、无规则卷曲分别占54%、17.78%、3.78%和24.44%,三级结构主要由α螺旋和无规则卷曲缠绕折叠形成;进化树结果表明,枸杞木虱的ORCO基因与半翅目蚜科昆虫聚为一支。本研究的枸杞木虱ORCO基因生物信息学分析结果,为研究验证该基因及其编码蛋白在枸杞木虱取食、交配和产卵等过程中所发挥的作用提供了理论基础。

分类号： S435.671

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