谷子HAK/KUP/KT钾转运蛋白家族全基因组鉴定及其对低钾和高盐胁迫的响应
文献类型: 中文期刊
第一作者: 代书桃
作者: 代书桃;朱灿灿;马小倩;秦娜;宋迎辉;魏昕;王春义;李君霞
作者机构:
关键词: 谷子;钾转运蛋白;KT/HAK/KUP家族;盐胁迫;表达分析
期刊名称: 作物学报
ISSN:
年卷期: 2023 年 008 期
页码: 2105-2121
收录情况: 北大核心 ; CSCD
摘要: KT/HAK/KUP (HAK)家族是植物中最丰富的钾转运体家族,对植物的生长和环境适应具有重要作用。谷子是抗逆耐瘠研究的模式植物,然而,谷子中HAK家族缺乏系统研究。本研究基于基因组序列信息,鉴定出29个谷子HAK基因(SiHAKs),并对该家族成员的基本特征、蛋白结构、染色体定位、基因复制、表达模式和逆境响应等方面进行了系统分析。结果显示,(1) SiHAKs分为5个进化簇(Cluster I~Cluster V),成员数量分别为11、9、3、3和3。基因结构和蛋白保守基序分析表明,谷子HAK家族具有较高的保守性,不同Cluster的保守性依次为:ClusterIII=Cluster V> Cluster II> Cluster I> Cluster IV。(2)串联复制是SiHAKs扩增的主要原因, 15个SiHAKs位于串联重复中。(3)171个转录因子可能结合到不同SiHAKs的启动子上,这些转录因子包含ERF、NAC、MYB和WRKY等家族中的大量成员,可能授予了SiHAKs对非生物胁迫多样的响应机制。(4)基因表达聚类将SiHAKs分成3组:GroupI、Group II和Group III,多数SiHAKs在张谷和豫谷1号2个品种中的表达模式具有一致性;不同Cluster表达水平总体表现为:Cluster III> Cluster V> Cluster II> Cluster I> Cluster IV。(5)根系中表达水平较高的11个SiHAKs用来检测对低钾和高盐胁迫的响应。在低钾胁迫后, 8个SiHAKs的表达水平显著升高, 1个SiHAK显著降低, 2个SiHAKs变化不明显;而高盐胁迫后,3个SiHAKs的表达水平显著升高,2个SiHAKs显著降低,其余6个SiHAKs变化不明显。SiHAK15受到低钾和高盐胁迫的响应最为强烈,其表达量分别为对照的151倍和22倍。(6)基因表达谱的差异反映出不同Cluster间SiHAKs的功能差异。ClusterI主要在根系中表达,可能参与谷子根系K+的吸收;ClusterII不具有组织表达特异性,推测其参与K+的吸收、转运和生长发育等多个生物过程; Cluster III受到低钾和高盐2种胁迫的诱导,显示出维持谷子K+/Na+平衡和抵御盐胁迫的潜在作用;ClusterIV在被检测的多个组织中几乎不表达;ClusterV不同成员对低钾和高盐胁迫的响应存在差异,可能发生了功能分化。研究结果不仅为深入解析谷子HAK家族的功能奠定了基础,而且为植物中钾高效利用和耐盐机制的研究提供了重要线索。
分类号: S515
- 相关文献
[1]盐胁迫对谷子幼苗生长及光合特性的影响. 徐心志,代小冬,杨育峰,马超,王雁楠,朱灿灿,秦娜,杨国红,李君霞. 2016
[2]NaCl处理谷子萌发期种子的转录组学分析. 潘教文,李臻,王庆国,管延安,李小波,戴绍军,丁国华,刘炜. 2019
[3]盐胁迫下谷子根部细胞内pH值测定. 李小波,潘教文,丁国华,李臻,王庆国,刘炜. 2019
[4]荧光素酶互补法对谷子中SiPKS32/SiCaBP5的互作研究. 潘教文,李丹,吴建国,李臻,王庆国,管延安,刘炜. 2018
[5]谷子萌发期耐盐种质筛选及其保护酶系统对盐胁迫的响应. 秦岭,张艳亭,陈二影,杨延兵,黎飞飞,管延安. 2019
[6]红麻谷胱甘肽还原酶基因(HcGR)的克隆及盐胁迫下表达分析. 梁国旺,李增强,周步进,常蒙蒙,陈涛,陈鹏. 2020
[7]大豆GmNF-YA8的生物信息学及盐胁迫表达分析. 李铭杨,张军,翟莹,何佳琦,邱爽,于海伟,陈炯辛,马婷婷. 2022
[8]花生水孔蛋白基因(AhAQ1)的克隆及盐胁迫下的表达分析(英文). 潘丽娟,杨庆利,江燕,禹山林. 2009
[9]陆地棉盐胁迫应答基因GhWRKY41的克隆与分析. 苏莹,甄军波,张曦,王玉美,李乐,华金平. 2016
[10]海马齿Δ~1-吡咯啉-5-羧酸合成酶(SpP5CS)基因的克隆和表达分析. 申龙斌,杨成龙,郭建春,段瑞军. 2015
[11]红麻HcMYB3基因克隆和表达分析. 杨大为,邓勇,张超,栾明宝,黄思齐,李建军,常丽,潘根,唐慧娟,李德芳. 2022
[12]大豆盐胁迫响应NRT基因的鉴定及GmNRT1.5A的克隆和表达分析. 王玉斌,张志贤,张辰淼,刘薇,张彦威,张礼凤,徐冉. 2023
[13]番茄BURP结构域基因家族全基因组鉴定及表达分析. 张福林,奚瑞,刘宇翔,陈兆龙,余庆辉,李宁. 2024
[14]3个紫花苜蓿乙烯应答因子基因的克隆与分析. 陈婷婷,杨青川,康俊梅,丁旺,张铁军,张新全. 2012
[15]叶面喷施钾肥对霞脆桃果实品质及KUP基因表达的影响. 宋志忠,许建兰,张斌斌,俞明亮,马瑞娟. 2018
[16]叶面喷施钾肥对霞脆桃果实品质及KUP基因表达的影响. 宋志忠,许建兰,张斌斌,俞明亮,马瑞娟. 2018
[17]谷子SiARGOS1的克隆、表达分析和功能标记开发. 王智兰,杜晓芬,王军,杨慧卿,王兴春,郭二虎,王玉文,袁峰,田岗,刘鑫,王秋兰,李会霞,张林义,彭书忠. 2017
[18]谷子SBP转录因子家族基因的表达分析. 杜晓芬,韩康妮,李禹欣,王智兰,连世超,王军. 2021
[19]谷子SiPRR37基因对光温、非生物胁迫的响应特点及其有利等位变异鉴定. 贾小平,李剑峰,张博,全建章,王永芳,赵渊,张小梅,王振山,桑璐曼,董志平. 2021
[20]谷子PEPC基因的鉴定及其对非生物逆境的响应特性. 赵晋锋,杜艳伟,王高鸿,李颜方,赵根有,王振华,王玉文,余爱丽. 2020
作者其他论文 更多>>
-
磷肥深施对谷子根系分布、养分利用及产量的影响
作者:樊永强;韩燕丽;王彦辉;张晓申;代书桃
关键词:谷子;磷肥深施;根系;肥料偏生产力;产量
-
不同施磷水平下外生菌根真菌对薄壳山核桃幼苗生长和磷吸收的影响
作者:陈婷;陈于;朱灿灿;王磊彬;赵玉强;王武;章钰晨;朱汤军;王敏;张仕杰
关键词:薄壳山核桃;外生菌根真菌;施磷水平;生长特性;土壤酶活性
-
谷子籽粒类黄酮含量和粒色的QTL定位
作者:秦娜;叶珍言;朱灿灿;付森杰;代书桃;宋迎辉;景雅;王春义;李君霞
关键词:谷子;类黄酮含量;粒色;QTL定位;候选基因
-
基于GGE双标图的绿豆品种郑绿20号的丰产稳定性分析
作者:王保勤;李君霞;周秋峰;黄长志
关键词:绿豆[Vigna radiate(L.)R. Wilczek];郑绿20号;相关性;GGE双标图;丰产性;稳产性
-
郑绿20在GGE双标图分析区试参试品种中的综合评价研究
作者:黄长志;王保勤;周秋峰;李君霞
关键词:郑绿20;农艺性状;相关性;GGE双标图;产量
-
基于GGE双标图对'豫谷28'的丰产稳产性及适应性分析
作者:樊永强;郜惠苹;韩燕丽;王彦辉;张晓申;李君霞
关键词:谷子;’豫谷28’;GGE双标图;丰产稳产性;适应性
-
低温胁迫对不同胚乳类型高粱幼苗的影响
作者:宋迎辉;朱灿灿;代书桃;秦娜;王春义;魏昕;张真;李君霞
关键词:高粱幼苗;低温胁迫;胚乳类型;生理特性