甲型H1N1流感病毒HA蛋白结构模建与构象表位分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 流感研究上海协作组

作者： 流感研究上海协作组;吴迪;徐天磊;孙静;戴建新

作者机构：

关键词： 甲型H1N1流感病毒;HA蛋白;空间表位;生物信息学

期刊名称： 科学通报

ISSN： 0023-074X

年卷期： 2009 年 12 期

页码： 1642-1644

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 最近几个月来,一种新型流感病毒H1N1在全球流行.本文运用生物信息技术,从NCBI发布的新型AH1N1流感病毒基因序列出发,通过同源模建方法构建了HA蛋白三维结构,利用自主开发的蛋白抗原空间表位预测程序SEPPA预测了HA蛋白潜在空间表位氨基酸,并与以往流感病毒HA蛋白潜在构象表位进行了比较.结果发现HA蛋白中58个氨基酸残基具有较强的免疫原性,大部分在HA蛋白球状头部表面上聚集成簇,构成空间抗原表位.与以往流感病毒HA蛋白潜在空间表位相比,虽然坐落位置相似,但新的抗原表位在静电势性质上明显不同于以往流感病毒HA蛋白抗原表位.

分类号： R373

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