硅缺乏调控小新月菱形藻中心碳代谢相关基因的表达

文献类型： 中文期刊

第一作者： 李亚军

作者： 李亚军;何金曼;张秀霞;邓晓东

作者机构：

关键词： 小新月菱形藻;硅缺乏;转录组测序;差异表达基因;GO功能分类;KEGG富集分析;中心碳代谢;基因调控

期刊名称： 生物技术

ISSN： 1004-311X

年卷期： 2025 年 35 卷 001 期

页码： 25-29,94

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： [目的]分析硅缺乏对小新月菱形藻基因在转录水平上的调控。[方法]收集缺硅24 h和正常培养条件下的藻细胞，利用illumina NovaSeq 6000平台对其RNA进行测序。以正常培养藻细胞为对照，鉴定硅缺乏条件下差异表达基因，并对其进行GO和KEGG显著性富集分析。[结果]以对照相比，共鉴定出668个基因和1 306个基因在硅缺乏时分别上调和下调表达。GO显著性分析结果表明，差异表达基因显著性富集在38个GO条目中，主要与阴离子转运，膜组分及转录因子活性等相关。8个KEGG显著性富集通路主要与中心碳代谢等途径相关。进一步分析差异基因表达模式，发现与糖酵解相关基因均下调表达，碳代谢相关基因在硅缺乏时上调表达。[结论]硅缺乏诱导小新月菱形藻1 974个基因在转录水平上差异表达，其中，糖代谢相关基因下调表达，而碳代谢相关基因上调表达。

分类号： Q943.2

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