人类1号染色体可变剪接与普通剪接基因同义密码子的使用分析 Ⅱ.基因表达水平和基因长度与密码子使用偏爱(英文)

文献类型: 中文期刊

第一作者: 陈学平

作者: 陈学平;武耀廷;张成;郭家明;马飞

作者机构:

关键词: 可变剪接;基因表达;基因长度;翻译选择;突变偏爱

期刊名称: 安徽农业大学学报

ISSN: 1000-2197

年卷期: 2004 年 31 卷 01 期

页码: 8-16

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 进一步研究基因表达水平和基因长度与密码子使用偏爱之间的关系。多变量统计分析发现,人类1号染色体选择性剪接基因和普通剪接基因密码子使用变化都呈现单一趋势,且它们之间的密码子使用模式也非常相似,推测的高表达基因确实偏爱以C或G结尾的密码子,基因表达水平与密码子使用偏爱之间的关联也达到显著水平。因此,人类1号染色体高表达基因密码子的使用偏爱可能主要被翻译选择所决定。此外,基因长度与密码子偏爱水平之间也存在高度相关,说明相对较短的基因具有较高的密码子使用偏爱,翻译选择可能缩短了高表达基因的长度从而提高翻译效率。

分类号: Q987

  • 相关文献

[1]一个水稻黄绿叶突变体ygl14(t)的鉴定及基因定位. 林添资,孙立亭,景德道,钱华飞,余波,曾生元,李闯,龚红兵. 2018

[2]猪TLR4基因可变剪接体的鉴定. 杨秀芹,翟春媛,李海涛,刘娣. 2011

[3]春性甘蓝型油菜FCA同源基因可变剪接体的克隆及表达研究. 张生萍,罗玉秀,杜德志,罗春燕,马小岗,赵志刚,许唱唱,张红生,吴鹏. 2016

[4]120日龄文昌鸡RNA-Seq基因结构及SNP分析. 顾丽红,李金明,张细权,邱峰芳,邢增杨,林哲敏. 2019

[5]猪NR1H3基因可变剪接体的克隆及表达特性研究. 张雪莲,晋大鹏,吴怡琦,李文霞,秦本源,蔡春波,高鹏飞,郭晓红,李步高,曹果清. 2020

[6]金定鸭卵巢组织转录组SNPs和可变剪接分析. 朱志明,缪中纬,章琳俐,李丽,辛清武,林顺东,郑嫩珠,黄勤楼. 2020

[7]肉鸡肌肉与脂肪组织基因组差异剪接基因分析. 张敏,王杰,孙艳发,钟礼鹏,李焰,许卫华,李虹仪,张茂,黄其春. 2018

[8]肌肉生长发育可变剪接研究进展. 孙燕勇,付绍印,何小龙,王标,刘永斌,张文广. 2021

[9]人类1号染色体可变剪接与普通剪接基因同义密码子的使用分析I.同义密码子偏爱使用分析. 陈学平,武耀廷,郭家明,张成,马飞. 2004

[10]凡纳滨对虾E75基因可变剪切形式的鉴定与分析. 杜江丽,张晓军,张小溪,袁剑波,高羿,李富花,相建海. 2019

[11]干旱胁迫下表观遗传机制对转C4型PEPC基因水稻种子萌发的影响. 宋凝曦,谢寅峰,李霞. 2020

[12]植物可变剪接研究进展. 徐悦,王希,申子萌. 2022

[13]中华猕猴桃基因组可变剪接事件鉴定及分析. 周晏秋,覃瑞,刘胜毅,李刚,黄军艳. 2015

[14]一个由可变剪接造成的水稻开颖不育突变体ohms1的鉴定及基因定位. 孙廉平,张迎信,张沛沛,杨正福,占小登,沈希宏,张振华,胡霞,轩丹丹,吴玮勋,曹立勇,程式华. 2015

[15]玉米ZmcpSRP54基因可变剪接分析. 关海英,何春梅,王娟,刘铁山,董瑞,刘春晓,刘强,汪黎明. 2019

[16]花生FAT基因家族的全基因组分析. 张会,单雷,李新国,郭峰,孟静静,万书波,彭振英. 2018

[17]花生丙二酰单酰CoA转酰基酶(MCMT)基因家族应对不同胁迫的响应模式. 彭振英,孟静静,唐朝辉,王建国,张佳蕾,郭峰,杨莎,张智猛,丁红,李新国,万书波. 2020

[18]芦笋两性花与雄花中发生可变剪接基因的差异分析. 黄玲,李琼英,韦树谷,赖佳,代顺冬,张骞方,曾华兰,刘佳,叶鹏盛. 2019

[19]合作猪TLR3及其剪接体的基因克隆与序列分析. 管齐赛,房永祥,贾怀杰,何小兵,周涛,景志忠. 2012

[20]猪CPB2基因可变剪接体的克隆及生物信息学研究. 夏博策,张凯艺,苗佳坤,杨宇,彭焕祺,王彦芳,杨述林. 2022

作者其他论文 更多>>