菠萝基因组SSR分子标记的开发

文献类型： 中文期刊

第一作者： 童和林

作者： 童和林;冯素萍;陈友;陈业渊;孙光明;武耀廷

作者机构：

关键词： 菠萝;基因组SSR标记;开发;验证

期刊名称： 果树学报

ISSN： 1009-9980

年卷期： 2010 年 27 卷 04 期

页码： 73-77

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 实验采用SAM法,以"台农17号"菠萝作为开发基因组SSR分子标记的植物材料,并对开发获得的SSR标记在16个菠萝品种中进行了验证。利用两对锚定引物和12对接头引物筛选菠萝基因组SAM文库,从中开发得到86条含有SSR位点的序列,对这86条序列用MISA软件搜索后得到94个SSR位点,其中单核苷酸重复3个,二核苷酸重复91个。二核苷酸重复仅有2种重复单元,一种是GA/CT,占二核苷酸重复总数的57.14%(52/91),另一种是AC/GT,占二核苷酸重复总数的42.86%(39/91)。研究未发现三核苷酸及以上的重复单元。36对SSR引物对16个材料的扩增结果显示,24对引物能够扩增出清晰、重复性好且符合预期大小的条带,其中13对引物具有多态性,可成为下一步构建菠萝指纹图谱、遗传多样性分析及基因定位等研究中有用的SSR标记。

分类号： S668.3

  • 相关文献

[1]常绿杜鹃种质遗传多样性分析及SSR指纹图谱构建. 张露,张平萍,解玮佳,许凤,彭绿春,宋杰,杜光辉,李世峰. 2025

[2]科技进步增产的“多年平均产量移动模型”的验证. 黄治平,郑宏艳,刘书田,米长虹,李敬亚. 2016

[3]粮食生产潜力短期预测的“趋势-波动模型”的验证. 米长虹,刘书田,郑宏艳,李敬亚,黄治平. 2016

[4]粮食估产的“通道-概率模型”的验证. 郑宏艳,李敬亚,刘书田,黄治平,米长虹. 2016

[5]基于冠层相对湿度的日光温室黄瓜叶片湿润时间估计模型. 李明,赵春江,乔淑,钱建平,杨信廷. 2010

[6]普莱斯科学论文引用关联关系验证-以图书情报学17种核心期刊为例. 吴雨华. 2009

[7]鱼源腐败希瓦氏菌生长/非生长界面模型的建立和验证. 郭全友,朱彦祺,姜朝军,李保国. 2020

[8]CENTURY模型在川西北高原草原的适用性研究. 陈超,李秋月,郭斌,庞艳梅. 2019

[9]基于智能算法的影响鲜切花价格因素验证方法探究. 钱晔,孙吉红,韦翌,杨菊,叶丹,黎斌林. 2018

[10]银杏实时荧光定量PCR分析中内参基因的选择与验证. 苏西娅,石元豹,杨晓明,汪贵斌,曹福亮. 2019

[11]利用Design-Expert响应面法优化南方稻谷防霉剂配方及验证. 张典典,高家东,戴彰言,张文虎,张友胜,刘军. 2021

[12]胡麻籽粒离散元仿真参数标定与排种试验验证. 石林榕,马周泰,赵武云,杨小平,孙步功,张建平. 2019

[13]土壤墒情诊断理论和方法. 侯彦林,李敬亚,米长虹,黄治平,刘书田,郑宏艳,丁健,王铄今. 2017

[14]Landsat 8地表温度产品验证与分析. 李胜林,刘波,赵犇,李大成,王宇恒,郭凤云. 2023

[15]APSIM-Sugar模型在云南半湿润半干旱蔗区的适应性研究. 毛钧,Inman-Bamber N G,陆鑫,Jackson P A,王靖,刘家勇,范源洪. 2018

[16]平衡法土壤墒情诊断模型. 李兆,黄治平,刘书田,侯彦林,郑宏艳,丁健,米长虹,王铄今. 2017

[17]高等级生物安全实验室通风大系统消毒效果的验证与评价. 陈鑫,李晓斌,魏徵,李佩儒,张志伟,张立国,郭建宏. 2024

[18]综合模型法土壤墒情诊断模型. 米长虹,郑宏艳,侯显达,侯彦林,刘书田,黄治平,丁健,王铄今. 2017

[19]马鹿特异性SNP分子标记的验证. 范欢欢,王天骄,董依萌,李洋,刘汇涛,邢秀梅. 2021

[20]鸡A-FABP基因不同基因型遗传效应及初步验证. 常国斌,周琼,栾德琴,陈蓉,王克华,窦套存,胡玉萍,陈国宏. 2011

作者其他论文 更多>>

微信小程序