基于转录组的三月李及其红肉突变体Expansin基因家族鉴定及分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 方智振

作者： 方智振;林炎娟;姜翠翠;周丹蓉;潘少霖;叶新福

作者机构：

关键词： 李;转录组;expansin家族;生物信息学分析;表达分析

期刊名称： 福建农业学报

ISSN： 1008-0384

年卷期： 2020 年 35 卷 009 期

页码： 919-928

收录情况： CSCD

摘要： [目的]Expansin是广泛存在于植物中的一类细胞壁蛋白,通过调节细胞壁柔韧性在植物生长发育过程中发挥作用.本研究旨在分析Expansin基因家族特征及其在果实成熟过程中的表达模式,并比较Expansin基因在三月李及其红肉突变体之间的差异表达.[方法]基于三月李及其红肉突变体果实成熟过程的转录组数据,采用生物信息学分析方法进行Expansin家族基因鉴定与分析.[结果]鉴定出33个李Expansin基因家族成员,编码蛋白长度在176~460 aa,分子量在19.21~51.33 kD,等电点4.62~9.83,大部分为位于细胞外的稳定亲水蛋白.系统进化树分析表明李Expansin家族成员可分为4个组:22个EXPA、6个EXPB、1个EXPLA和4个EXPLB.所有李Expansin蛋白质均具有保守的DPBB_1和Pollen_allerg_1结构域.保守基序分析表明,同一组Expansin成员具有相似的基序组成.9个Expansin基因在三月李及其红肉突变体果实成熟过程中差异表达.[结论]Expansin在三月李及其红肉突变体果实成熟过程中的表达模式存在显著差异.本研究结果可为解析李Expansin家族基因在果实成熟过程中的功能奠定基础.

分类号： S662.3

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