基于DNA条码基因的鳢科鱼类系统进化与物种鉴定

文献类型： 中文期刊

第一作者： 赵建

作者： 赵建;梁宏伟;孙博;李伟;朱新平;叶朝阳;上官清;陈昆慈

作者机构：

关键词： 鳢;线粒体COI基因;DNA条码

期刊名称： 中国水产科学

ISSN： 1005-8737

年卷期： 2018 年 04 期

页码： 793-802

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 鳢科(Channidae)鱼类在亚洲分布广泛,其中中国的土著种类是重要养殖品种,国外很多种类主要作为观赏鱼引进我国。本研究利用线粒体COΙ基因序列,对分布于我国的鳢科鱼类不同种群样本序列,及在Gen Bank中获得其他鳢科鱼类的序列进行分析,探讨其作为DNA条形码基因对鳢科进行物种鉴定和系统进化分析的可行性。通过对本研究采集的149个鳢样本和122条Gen Bank中已有序列进行分析,结果显示,所研究的鳢科鱼类的COΙ基因576 bp片段中不存在碱基插入缺失现象,其平均碱基含量A+T(51.4%)高于G+C含量(48.6%),存在偏倚性;多态位点占47.2%。利用Mega 6.0软件基于Kimura’s 2-parameter模型计算25种鳢种内平均遗传距离为0.028,其中巴卡鳢(Channidae barca)种内遗传距离最大,为0.137,超过了某些种间遗传距离;种间遗传距离为0.030~0.302,平均为0.217。其中最大距离0.302为饰鳍鳢(Channidae ornatipinnis)和黑体鳢(Channidae melasoma)之间,甚至超过了与外群之间的距离。利用邻接法(Neighbour-Joining,NJ)和最大似然法(Maximum Likelihood Tree,ML)分别构建系统进化树,同种个体获得较高支持率,而不同种间的关系支持率较低,同时发现存在由多个种组成的巴卡鳢和南鳢复合支系。本研究表明,进行我国土著鳢科鱼类物种鉴定时COI基因是有效的工具,而进行外来观赏鱼鉴定,尤其是巴卡鳢、斯氏鳢等物种进行鉴定时,需结合多方面信息;COI基因不适合鳢科鱼类种间遗传进化关系的研究。

分类号： S917.4

  • 相关文献

[1]鲫属鱼类DNA条码及种与亚种划分. 程磊,常玉梅,鲁翠云,曹顶臣,孙效文. 2012

[2]利用DNA条码对农产品产地溯源研究——黑木耳产地分子溯源. 王东,郭灵安,雷绍荣. 2014

[3]入侵云南草地贪夜蛾的分子鉴定. 张磊,靳明辉,张丹丹,姜玉英,刘杰,吴孔明,萧玉涛. 2019

[4]低温胁迫对乌鳢、斑鳢及其杂种血清生化指标的影响. 李敏芬,罗青,赵建,徐红艳,史燕,洪孝友,朱新平,陈昆慈. 2016

[5]基于16S rRNA高通量测序的鳢肠道微生物群落结构研究. 徐晟云,陈昆慈,罗青,刘海洋,欧密,上官清,赵建. 2020

[6]鳢流行性溃疡综合征病原分离鉴定与病理形态学观察. 常藕琴,石存斌,王亚军,刘春,陈绮梨,霍礼侠. 2019

[7]中国东北地区亚洲玉米螟遗传多样性及寄主专化性分析. 王克勤,刘兴龙,邵天玉. 2018

[8]基于mtCOI基因序列的中国葱斑潜蝇不同地理种群遗传多样性分析. 钟裕俊,杜素洁,潘立婷,王玉生,王福莲,刘万学. 2020

[9]基于线粒体COI基因的3种草蛉的系统发育关系分析. 胡红岩,张职显,卢珍华,任相亮,马小艳,马亚杰,宋贤鹏,马艳. 2021

[10]DNA条形码技术在农林入侵害虫鉴定与溯源研究中的应用. 万方浩,张桂芬. 2016

[11]3种鲳属鱼类线粒体COI基因序列变异及系统进化. 张凤英,马凌波,施兆鸿,马春艳. 2008

[12]基于DNA序列的12种粉蚧亲缘关系分析. 何衍彪,万宣伍,詹儒林,孙光明,刘映红,许再福,赵艳龙. 2011

[13]DNA条形码技术在农林入侵害虫鉴定与溯源研究中的应用. 万方浩,张桂芬. 2016

[14]基于线粒体COI基因的部分鲇形目鱼类系统发育研究. 陈海港,朱新平,李伟,刘毅辉,赵建,叶朝阳,公月月. 2018

[15]基于COI基因的鸽遗传多样性和品种鉴定研究. 陆俊贤,贾晓旭,付胜勇,唐修君,樊艳凤,葛庆联,卜柱,高玉时. 2020

[16]国际生命条形码计划—DNABarcoding. 程佳月,王丽华,彭克美,张宁波,唐中林,杨述林,李奎. 2009

[17]福建省烟粉虱不同地理种群遗传结构特征. 郑宇,姚凤銮,黄晓燕,丁雪玲,何玉仙,翁启勇. 2016

[18]国际生命条形码计划—DNA Barcoding. 程佳月,王丽华,彭克美,张宁波,唐中林,杨述林,李奎. 2009

作者其他论文 更多>>

微信小程序