冬瓜WRKY基因家族鉴定及表达分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 赵添悦

作者： 赵添悦;蔡金森;王敏;谢大森;杨松光;崔晓娟;高苏娟

作者机构：

关键词： 冬瓜;WRKY基因家族;生物信息学;系统发育分析;表达分析

期刊名称： 广东农业科学

ISSN： 1004-874X

年卷期： 2024 年 51 卷 002 期

页码： 39-52

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： [目的]WRKY转录因子家族在植物生长发育、抵御胁迫等过程起着至关重要的作用.挖掘参与冬瓜(Benincasa hispida Cogn.)非生物胁迫的WRKY基因家族成员,探究其生物学功能.[方法]基于冬瓜基因组数据库鉴定冬瓜WRKY成员,利用生物信息学的方法系统分析其WRKY基因家族成员的蛋白理化性质、系统发育、保守基序、顺式作用元件,通过qPCR分析冬瓜WRKY的表达情况.[结果]冬瓜WRKY基因家族有 57 个成员,氨基酸数目在 126~650 之间,相对分子质量在 13.92~71.68 kD之间;蛋白等电点在 4.61~9.69 之间.根据系统进化树将该家族分为 3 个类群,第二类群又分为 5 个亚组.冬瓜WRKY外显子有 2~6 个.染色体定位分析发现,有 56个基因定位在12条染色体上,1个基因未定位在染色体上.保守基序分析显示,Motif 1和Motif 3存在于56个基因,且同一类群具有类似的保守基序结构.同时,冬瓜WRKY基因的启动子上均含有应激反应相关元件、激素响应元件.WRKY在冬瓜不同组织和果实发育时期特异表达.RT-PCR结果表明非生物胁迫和激素处理冬瓜可诱导部分WRKY基因的表达.[结论]共鉴定出 57 个冬瓜WRKY基因,同亚组的成员具有类似的保守基序结构.冬瓜WRKY基因在不同组织中的表达存在差异,其中,BhWRKY2、BhWRKY5、BhWRKY39、BhWRKY11、BhWRKY31、BhWRKY53参与不同的胁迫响应.

分类号： S641.3

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