甜玉米籽粒体积和粒重的全基因组关联分析
文献类型: 中文期刊
第一作者: 肖颖妮
作者: 肖颖妮;李高科;李坤;于永涛;李光玉;李武;高颖珊;胡建广
作者机构:
关键词: 甜玉米;籽粒体积;粒重;全基因组关联分析
期刊名称: 中国农业大学学报
ISSN: 1007-4333
年卷期: 2022 年 27 卷 007 期
页码: 12-25
收录情况: 北大核心 ; CSCD
摘要: 为挖掘控制甜玉米籽粒体积和粒重的相关基因,2017-2019年,以209份甜玉米自交系构成的关联群体为材料,测定干籽粒的体积和粒重,结合全基因组重测序(De novo sequencing)获得的980万个单核苷酸多态性(Single-nucleotide polymorphism,SNP)标记,采用GLM模型进行全基因组关联分析.结果表明,甜玉米籽粒体积变异范围为0.06~0.15 mL,变异倍数为2.5倍,单粒重变异范围为0.08~0.17 g,变异倍数为2.1倍,均符合正态分布.共检测到15个SNP位点与籽粒体积或粒重显著关联,分别解释籽粒体积55.7%和粒重52.1%的表型变异,其中4个位点和普通玉米报道的QTL重叠,其余11个是新鉴定的位点,通过基因注释发现大部分候选基因为转录因子等调控基因.此外,首次检测到Br2(矮化基因2)与籽粒体积、粒重两性状均显著关联,并且籽粒体积和粒重均随着该基因表达量的升高而增加.
分类号: S513
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