烟草TPP基因家族鉴定及表达模式分析
文献类型: 中文期刊
第一作者: 刘涛
作者: 刘涛;郭存;邹宗庆;金立权;吴健;文利超;邓智超;初雨蒙;王凌涛;李伟;郭永峰
作者机构:
关键词: 烟草;海藻糖-6-磷酸磷酸酶(TPP);干旱胁迫;盐胁迫;表达模式
期刊名称: 中国烟草科学
ISSN: 1007-5119
年卷期: 2022 年 43 卷 006 期
页码: 1-8,16
收录情况: 北大核心 ; CSCD
摘要: 海藻糖-6-磷酸磷酸酶(TPP)是植物海藻糖代谢过程的关键酶,在植物的生长发育及非生物胁迫响应过程中发挥着重要的作用.为挖掘参与烟草发育及抗逆胁迫的TPP基因家族成员,本研究通过生物信息学的方法,在普通烟草基因组中共鉴定出了15个TPP基因,其中7个TPP基因定位在染色体上.系统进化分析发现,新鉴定的烟草TPP成员可分为3个亚家族,分别为CLASS I、CLASSⅡ和CLASSⅢ.共线性分析表明,有5个烟草NtTPP基因分别与7个拟南芥AtTPP基因形成同源基因对.启动子分析发现,NtTPP成员的启动子上存在多种激素和非生物胁迫响应元件.表达模式分析发现,NtTPP基因表达具有一定的组织特异性,大部分NtTPP基因在根中的表达量最高,有12个NtTPP基因在干旱胁迫下表达量上调,13个NtTPP基因能够被盐胁迫显著诱导表达.这说明NtTPP基因家族成员在烟草非生物胁迫应答中发挥着重要作用.
分类号: S572.03
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