过表达TLR4基因绵羊瘤胃与肠道宏基因组分析
文献类型: 中文期刊
第一作者: 卢畅
作者: 卢畅;逯钧;宋旭婷;王福明;亓美玉;刘玉峰;陆明海;姚玉昌
作者机构:
关键词: 绵羊;TLR4基因;胃肠道微生物;KEGG
期刊名称: 中国畜牧杂志
ISSN: 0258-7033
年卷期: 2023 年 59 卷 009 期
页码: 206-214
收录情况: 北大核心 ; CSCD
摘要: 胃肠道微生物生态系统参与机体物质代谢、生物屏障、免疫调控等生理过程,对维持宿主健康具有重要作用.Toll样受体 4(Toll-like Receptor 4,TLR4)除在机体天然免疫过程中扮演关键角色之外,胃肠道中TLR4基因的表达可能参与微生物区系结构的塑造.本研究利用前期获得的过表达TLR4基因绵羊,基于宏基因组测序技术探讨TLR4基因高水平表达对绵羊胃肠道微生物群体多样性、丰度及生物学功能的影响.结果表明:TLR4基因过表达后对绵羊瘤胃(P=0.35)和肠道(P=0.56)中微生物Alpha多样性无显著影响;胃肠道中微生物优势菌群(相对丰度>1%)在门、属、种不同分类水平上的区系结构无显著变化.进一步分析TLR4基因过表达对胃肠道中革兰氏阴性菌群(相对丰度<1%)组成的影响,在瘤胃和肠道中分别鉴定出8 个和 13 个差异菌属(P<0.05),33 个和 32 个差异菌种(P<0.05);其中,Helicobacter sp.MIT 05-5293(P=0.03)和Yersinia pseudotuberculosis(P=0.048)在瘤胃中存在显著差异,Campylobacter hominis(P=0.048)和Escherichia coli(P=0.04)在肠道中存在显著差异.同时,TLR4基因过表达对胃肠道中KEGG level 1 和level 2途径的主要通路无明显影响,仅在肠道中KEGG level 2途径的神经变性疾病通路存在差异(P=0.04);而在KEGG level 3 途径,瘤胃和肠道中分别有 11 条和 6 条非关键通路存在差异.综上,TLR4基因高水平表达对绵羊胃肠道微生物群体多样性、丰度及生物学功能未造成广泛影响,胃肠道微生物生态系统整体上仍处于稳定状态.
分类号: S826.2
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