玉米抗感粗缩病重要miRNA及其靶基因的诠释

文献类型： 中文期刊

第一作者： 吴斌

作者： 吴斌;崔汉青;张眉;邵春国;姜珊珊;郭霞;徐德坤;王升吉

作者机构：

关键词： 玉米粗缩病;差异miRNA;高通量测序;靶基因;富集分析

期刊名称： 江苏农业科学

ISSN： 1002-1302

年卷期： 2021 年 020 期

页码： 64-69

收录情况： 北大核心

摘要： 借助高通量测序和生物学分析手段,筛选不同抗性品种间的差异表达miRNA,预测相关靶基因。对玉米抗、感粗缩病不同种质材料高通量测序鉴定出的差异miRNA的靶基因,在Genome、Gene Ontology等生物信息数据库中进行比对,同时做GO（Gene Ontology,简称GO）、京都基因和基因组百科全书（Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes,简称KEGG）富集性分析。从某些相关差异miRNA的靶基因及其作用位点的有关GO ID及其生物学功能注释中,发现一些可能与玉米粗缩病抗性有较大关系的miRNA,如zma-miR156a、zma-miR156k、zma-miR1432等;通过进一步的miRNA靶基因KEGG富集性分析,获得代谢通路ID,根据其生物功能注释,推测也有一定数量的miRNA与玉米种质抗（感）病相关。结合所涉差异miRNA在玉米抗、感种质接毒前后上、下调的表现,对这些重要miRNA靶基因可能涉及粗缩病的致病机制或玉米抗性相关的GO ID、KEGG通路ID所蕴含的功能进行了诠释。研究旨在探明抗病相关miRNA通过靶向作用其靶基因,在抗病过程中可能发挥的重要生物学功能和作用途径,研究结果可为探讨玉米抗粗缩病的抗病机制研究奠定理论基础。

分类号： S435.131.4

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