基于生物信息学分析紫花苜蓿耐盐碱核心基因

文献类型： 中文期刊

第一作者： 张军

作者： 张军;高海娟;孙蕊;王若丁;李伟;王晓龙;李莎莎;柴华;杨曌

作者机构：

关键词： 紫花苜蓿;盐碱胁迫;GEO数据库;生物信息学

期刊名称： 现代畜牧科技

ISSN： 2095-9737

年卷期： 2025 年 009 期

页码： 12-16

摘要： 为筛选盐碱胁迫下紫花苜蓿核心差异表达基因和相关的代谢通路。通过检索GEO数据库中与紫花苜蓿盐碱胁迫相关的芯片数据集，并利用GEO中的GEO2R工具筛选差异基因，然后利用DAVID数据库对筛选后的差异表达基因进行GO富集和KEGG富集注释，再结合STRING数据库对差异表达基因构建蛋白质互作关系网络图。研究结果表明，确定芯片GSE13921中的6个样本GSM350627、GSM350628、GSM350629和GSM350640、GSM350642、GSM350646样本为研究对象，筛选出9 787个差异表达基因，其中4 947个上调差异表达基因，4 840个下调差异表达基因；通过DAVID在线功能富集分析可知，盐碱胁迫主要对紫花苜蓿体内的蛋白质磷酸化、过氧化氢分解过程、跨膜运输、碳水化合物的代谢过程，以及黄酮类化合物生物合成和苯丙烷类生物合成等途径有显著影响。该研究结果以期为研究紫花苜蓿抗盐碱机理提供一定的理论依据。

分类号： S541.9

  • 相关文献

[1]基于GEO数据库分析番茄干旱胁迫关键基因与信号通路. 杨巍,唐兵,周麟笔,马关鹏,谭国飞,瞿飞,王天文,曾庆鸿,王洪亮,邓英. 2022

[2]玉米ZmRINO1基因盐碱逆境胁迫下的表达及生物信息学分析. 吕庆雪,何欢,高嵩,牛铭晨,孙蕾,李毅丹,张建新,王敏,宋广树,刘文国. 2019

[3]玉米P5CS基因家族全基因组鉴定及生物信息学分析. 刘俊宇,张春宵,孙博,董菁,石创业,吴委林,李晓辉. 2025

[4]玉米HKT基因家族全基因组鉴定及生物信息学分析. 孙博,张春宵,刘俊宇,焦仁海,董菁,吴松权,李晓辉. 2024

[5]ZmHAK基因家族鉴定及盐碱胁迫下的表达分析. 李承阳,张春宵,黄威,孙利全,董菁,周文倩,吴委林,李晓辉. 2025

[6]盐碱胁迫对苗期紫花苜蓿生理特性的影响. 张永锋,梁正伟,隋丽,崔彦如. 2009

[7]PuCAT/Bar抗逆抗除草剂基因共转化紫花苜蓿的研究. 任伟,王嘉莹,任华华,王英哲,王梦寒,徐安凯. 2017

[8]盐碱胁迫对紫花苜蓿根、茎和叶重要养分离子平衡的影响. 王小山,朱平华,鲍国成,顾洪如. 2013

[9]紫花苜蓿根际芽胞杆菌YB-2的鉴定及其生防和促生能力分析. 史怡梦,张旖璐,张莹,陈佳欣,王丹,申忠宝,郭长虹. 2023

[10]盐碱胁迫对苜蓿种子萌发性状的影响及耐盐碱性评价. 陈雪梅,刘骅峻,杨曌,朱琨,李波. 2024

[11]盐碱胁迫下的紫花苜蓿幼苗蛋白组差异分析. 杨永念,曾祥翠,刘青松,李如月,龙瑞才,陈林,王雪,何飞,康俊梅,李明娜. 2025

[12]紫花苜蓿几丁质酶ClassⅢ基因克隆及生物信息学分析. 张文娟,李聪,王涌鑫,苗丽宏. 2010

[13]盐碱胁迫下芝麻种子萌发过程中营养物质的动态变化规律. 许兰杰,梁慧珍,余永亮,杨红旗,董薇,牛永光,芦海灵,曹杰,吕爱淑. 2016

[14]盐碱胁迫下羊草的生理特性与适应机制. 李新玲,徐香玲,张月学. 2012

[15]玉米ZmNAC6基因克隆及盐碱逆境胁迫下的表达分析. 何欢,高嵩,吕庆雪,牛铭晨,孙蕾,李毅丹,张建新,王敏,宋广树,刘文国. 2018

[16]玉米ZmWRKY45基因克隆及盐碱逆境胁迫下的表达分析. 吕庆雪,高嵩,何欢,孙蕾,李毅丹,才卓,徐国良,张建新,林志,宋广树,刘文国. 2017

[17]不同浓度盐、碱胁迫对野生大豆光合特性和生理生化特性的影响. 盖玉红,牛陆,董宝池,魏健. 2014

[18]胁迫对蜀葵的影响研究进展. 李云芝,刘文光,刘惠芬,郭洪恩. 2016

[19]盐碱胁迫对枸杞生长及根际适应能力的影响. 付任胜,尹立荣,陈磊,孙鹏,管长志. 2012

[20]根际促生菌对棉苗盐碱胁迫的缓解效应. 庞学兵,王朝阳,王爱英,易小龙,郭建强,裴娟,王军. 2017

作者其他论文 更多>>

微信小程序