miR-499基因家族进化分析及其对鸡骨骼肌肌纤维类型调控的研究

文献类型： 中文期刊

第一作者： 石诗影

作者： 石诗影;巨晓军;屠云洁;单艳菊;姬改革;刘一帆;章明;束婧婷

作者机构：

关键词： 鸡;miR-499;分子进化;肌纤维类型

期刊名称： 家畜生态学报

ISSN： 1673-1182

年卷期： 2022 年 012 期

页码： 15-22

收录情况： 北大核心

摘要： 为了对miR-499进行序列进化分析、靶基因预测、鉴定和表达量分析，探究其对鸡骨骼肌肌纤维类型的具体调控作用，在miRBase数据库检索miR-499基因家族的序列，利用ClustalX软件对序列特征进行分析，采用MEGA7.0构建miR-499系统发育树，再利用生物信息学工具进行靶基因预测和功能富集，最后通过荧光定量PCR和双荧光素酶报告基因试验对miR-499及其靶基因SOX6在鸡快肌和慢肌的表达量和靶向结合关系进行检测。结果发现，在43种脊椎动物中查询到75条miR-499基因家族序列，主要位于MYH7B基因内含子区，且具有较高的保守性。进化分析表明，miR-499序列进化中符合物种进化演变的规律。靶基因功能富集发现，miR-499与组织发育和能量代谢等过程有关。荧光定量检测结果显示，miR-499在鸡慢肌中表达量显著高于快肌（P＜0.05）,与SOX6的表达规律相反。双荧光素酶报告基因试验发现，SOX6的表达能够被miR-499-5p靶向抑制，提示miR-499可能通过SOX6基因参与肌纤维类型调控。

分类号： S831

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