须鳗虾虎鱼线粒体全基因组测序和系统发育分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 梁阳阳

作者： 梁阳阳;张国庆;陈诚;赵秀侠;高娜;李静;方婷;杨坤;尹峰;郭伟;卢文轩

作者机构：

关键词： 须鳗虾虎鱼;线粒体基因组;系统发育

期刊名称： 大连海洋大学学报

ISSN：

年卷期： 2023 年 005 期

页码： 772-778

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 为了解须鳗虾虎鱼（Taenioides cirratus）线粒体基因组特征和系统发育状况，采用Illumina Hiseq高通量测序技术，测定了从南渡江口、珠江口、太湖、巢湖和南四湖中采集的12尾须鳗虾虎鱼的线粒体全基因组，并下载近缘种线粒体全基因组序列进行系统发育分析。结果表明：须鳗虾虎鱼线粒体全基因组长为16 641～16 978 bp,包含13个蛋白编码基因、22个tRNA基因、2个rRNA基因和1个D-loop控制区，各样本的编码基因序列长度较一致，线粒体全基因组长度差异主要是由控制区长度（975～1 314 bp）差异造成的；基于13个蛋白编码基因和2个rRNA基因序列构建系统发育树，须鳗虾虎鱼分为3个高支持率进化枝，与红狼牙虾虎鱼（Odontamblyopus rubicundus）、鲡形鳗虾虎鱼（Taenioides anguillaris）形成并系，太湖、巢湖和南四湖的须鳗虾虎鱼个体聚为1个进化枝，南渡江口和珠江口的须鳗虾虎鱼个体均分属2个进化枝。研究表明，青藏高原隆起和亚洲季风形成带来的中国水系格局变化，可能是须鳗虾虎鱼形成目前系统发育结构的重要原因，本研究结果可为进一步明确须鳗虾虎鱼的分类地位和资源保护提供重要依据。

分类号： S917.4

  • 相关文献

[1]绿头鸭线粒体基因组全序列分析及河鸭类系统发育. 涂剑锋,黄银花,刘三凤,李宁. 2009

[2]日本鼓虾线粒体基因组:真虾下目内部的基因重排与系统发育. 申欣,李晓,沙忠利,阎斌伦,徐启华. 2012

[3]印度谷螟线粒体基因组测定及螟蛾总科系统发育分析. 唐培安,吴海晶,王娟,郭仲龙,袁明龙. 2015

[4]半翅目昆虫线粒体基因组学研究进展. 郭仲龙,袁明龙. 2016

[5]绿眼赛茧蜂线粒体基因组全序列测定和分析. 王丹阳,王予彤,于良斌,韩海斌,徐林波,崔艳伟,康爱国,庞红岩. 2020

[6]小红珠绢蝶线粒体基因组特征及基于线粒体基因组的蝶类高级阶元系统发育关系分析. 张敏,赵盼,尹洁,李涛,张婷婷,曹天文,马恩波. 2017

[7]扬眉线蛱蝶线粒体基因组全序列测定和分析. 王菊平,曹天文,张越,范仁俊,张苗,石保明,彭福成. 2017

[8]武铠蛱蝶线粒体基因组全序列测定和分析. 王菊平,宣善滨,张育平,杨静,曹天文,马恩波. 2015

[9]肃北牦牛线粒体基因组与牛亚科系统发育研究. 王兴东,曹梦丽,郭韶珂,裴杰,包鹏甲,梁春年,阎萍,赵双全,郭宪. 2022

[10]变灰青霉线粒体基因组特征及系统发育分析. 康瑞萍,艾菲热·阿布都艾尼,周慧英,索菲娅,丁明亮. 2022

[11]黑肩绿盲蝽的线粒体基因组结构. 许常玉,刘玉娣,侯茂林. 2024

[12]拟腹吸鳅属鱼类线粒体基因组特征与系统发育分析. 宋小晶,凌建忠. 2024

[13]强壮粗体虫的线粒体基因组及棘头虫的系统发育研究. 潘庭双,聂品. 2014

[14]我国家养雉鸡线粒体基因组的比较及系统发育研究. 吴琼,杨福合,宁浩然,涂剑锋,荣敏,徐佳萍,杨颖,邢秀梅. 2015

[15]琥珀蚕线粒体全基因组测序及序列分析. 钟健,刘增虎,杨伟克,朱峰,董占鹏. 2017

[16]麻竖毛天牛线粒体基因组测定及天牛科线粒体基因组比较分析. 杨锦,曹利军,耿涌鑫,魏丹峰,陈敏. 2017

[17]尼罗罗非鱼线粒体基因组全序列测定与系统进化分析. 杨丽萍,卢迈新,叶星,朱华平,高风英,莫媛媛,黄樟翰. 2010

[18]汞胁迫下脊尾白虾线粒体基因组拷贝数变化特征分析. 张培,李志辉,赵莲,薛蓓,李明传,赖晓芳,阎斌伦,高焕. 2016

[19]建昌鸭线粒体基因组全序列分析. 涂剑锋,黄银花,刘三凤,李宁. 2010

[20]不同地理群体三疣梭子蟹mtDNA本底甲基化水平分析. 闻奋亮,王银海,赵莲,赖晓芳,阎斌伦,高焕. 2017

作者其他论文 更多>>

微信小程序