基于RNA-Seq对心肌肌钙蛋白Ⅰ R193H突变限制性心肌病小鼠转录组的分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 干意

作者： 干意;封叶;赵唯安;刘振国;张蕾;田杰

作者机构：

关键词： 心肌肌钙蛋白Ⅰ;限制性心肌病;RNA-Seq;生物信息学分析

期刊名称： 解放军医学杂志

ISSN： 0577-7402

年卷期： 2018 年 11 期

页码： 924-932

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 目的利用RNA-Seq检测正常小鼠与心肌肌钙蛋白Ⅰ(cTnⅠ)R193H突变所致限制性心肌病(RCM)小鼠中差异表达的基因,探索RCM的发病机制。方法取3月龄C57小鼠和c TnI 193H突变小鼠的心脏,提取心肌组织全mRNA,并反转录成cDNA,PCR扩增后构建文库,进行高通量测序。分析测序结果,获得差异表达的基因,利用生物信息学方法分析其可能参与的生物学过程。结果共鉴定出52个差异表达基因,其中高表达基因28个,低表达基因24个(P<0.05),共涉及到16条相关KEGG通路,主要参与免疫和代谢相关的生物学过程。结论 c TnI突变可引起基因差异表达,免疫应答、线粒体能量代谢、心肌细胞分化等过程可能参与了RCM的发生发展过程。

分类号： R542.2

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