湖羊lncRNA-269的鉴定及转录调控分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 舒嘉傲

作者： 舒嘉傲;曹少先;孟春花;钱勇;张俊;张建丽;丁强;李隐侠;李齐发

作者机构：

关键词： 湖羊;卵巢卵泡;lncRNA-269;5′/3′RACE;染色质免疫沉淀(ChIP)

期刊名称： 南京农业大学学报

ISSN： 1000-2030

年卷期： 2024 年 47 卷 001 期

页码： 174-182

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： [目的]本文旨在研究湖羊长链非编码RNA-269(long no-coding RNA-269,lncRNA-269)序列特征、表达模式和转录调控,为后续开展lncRNA-269的功能研究提供理论基础.[方法]以湖羊为研究对象,采用 5′/3′RACE结合PCR扩增方法获得其序列全长,利用RT-qPCR方法鉴定其在湖羊组织中的表达模式,并利用PCR方法扩增其启动子区,鉴定其启动子区特征,分析其转录调控情况.[结果]湖羊lncRNA-269全长3 146 bp,组织表达谱显示其在湖羊各组织中广泛表达,且在健康卵泡中显著高表达,其表达水平与NR5A1 mRNA水平和血清中雌二醇(E2)水平呈正相关.荧光素酶活性分析发现在lncRNA-269 启动子区的-359~-17 nt有1个转录激活基序,在-1 485~-942 nt有1个转录抑制基序.JASPAR软件预测发现在lncRNA-269 转录抑制启动子区域存在FOXO3、PDX1等转录因子结合位点,在转录激活区域有SMAD4、YY1 等转录因子结合位点.过表达SMAD4可显著提升lncRNA-269启动子区荧光素酶活性,染色质免疫沉淀(ChIP)-PCR试验进一步确认了SMAD4 特异性与lncRNA-269启动子区结合.[结论]湖羊lncRNA-269在健康卵泡中显著高表达,其启动子区存在一个转录激活区域和一个转录抑制区域,转录因子SMAD4可通过与lncRNA-269启动子区结合显著上调lncRNA-269的启动子活性.

分类号： S826

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