利用cDNA-AFLP分析内生解淀粉芽胞杆菌Fy11诱导辣椒差异表达基因

文献类型： 中文期刊

第一作者： 杨瑞先

作者： 杨瑞先;范晓静;邱思鑫;蔡学清;胡方平

作者机构：

关键词： 辣椒;内生解淀粉芽胞杆菌;互作;基因表达;cDNA-AFLP;qRT-PCR

期刊名称： 中国农业科学

ISSN： 0578-1752

年卷期： 2013 年 46 卷 012 期

页码： 2449-2458

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： [目的]分析内生解淀粉芽胞杆菌(Bacillus amyloliquefaciens)Fy11诱导辣椒(Capsicum annuum)幼苗差异表达基因,了解辣椒与内生芽胞杆菌互作的分子机制.[方法]利用cDNA-AFLP技术,采用256对引物,分析辣椒幼苗接种内生解淀粉芽胞杆菌Fy11后5个时间点的基因表达谱;利用qRT-PCR分析差异基因表达模式,验证cDNA-AFLP表达谱.[结果]256对引物共产生18 620个转录本(TDF),筛选获得353条差异表达条带,占扩增条带总数的1.89%.经克隆、测序分析,最终获得257个差异TDF,聚类分析得到229个独立基因(EST,unigenes),其中144个基因上调表达,85个基因下调表达.经Blastx比对和功能分类分析,其中65条EST(28.38%)未找到同源性匹配,8条(3.49%)与未知功能蛋白同源性较高.其余156条EST主要涉及基础代谢基因(10.92%);与能量和抗病与防御类相关基因,各占8.73%;信号转导基因占7.42%;转运子或转座子基因占6.99%;与细胞结构相关基因占6.55%;参与转录调控基因占5.68%;细胞生长类基因占3.93%;参与蛋白质运输和储存有8个基因,占3.49%;蛋白质合成类基因占2.18%;次生代谢类和胞间运输类基因,其数量相对较少,各占1.75%.选取与抗病防御、转录调控及信号转导类等相关的10个差异基因,qRT-PCR分析结果显示其表达模式符合cDNA-AFLP表达谱.[结论]内生细菌与植物互作的分子机制涉及植物多方面生理生化反应,包括抗病防御、转录调控、蛋白质代谢、信号转导、以及非生物胁迫等多种途径相关基因的协同控制.

分类号： S641.3

  • 相关文献

[1]辣椒胞质雄性不育相关基因的克隆及表达. 王述彬,刁卫平,刘金兵,潘宝贵,戈伟,郭广君. 2014

[2]茶树冷诱导基因的AFLP筛选及其表达分析. 陈林波,李叶云,房超,朱政,江昌俊. 2011

[3]人工合成甘蓝型油菜S_0-S_3代DNA及cDNA的AFLP分析. 邓昌蓉,赵志刚,余青兰,姚艳梅,杜德志. 2014

[4]四种甘蓝雄性不育类型差异基因表达分析. 康俊根,张国裕,张延国,娄平,王晓武,方智远. 2006

[5]利用cDNA-AFLP检测甘蓝雄性不育相关基因的时序性表达. 康俊根,王晓武,张国裕,张延国,娄平,方智远. 2006

[6]cDNA-AFLP技术及其在植物基因表达分析中的应用. 赵继荣,雒淑珍,张增艳,刘红霞. 2009

[7]哈克尼西棉细胞质雄性不育系和保持系差异表达基因分析. 吴建勇,邢朝柱,郭立平,巩养仓,崔明晖,王海林. 2009

[8]棉花细胞核雄性不育两用系差异表达基因分析(英文). 邢朝柱,郭立平,巩养仓,王海林,赵云雷,吴建勇. 2007

[9]cDNA-AFLP技术及其在基因表达研究中的应用. 姜立杰,张开春,张晓明. 2003

[10]优质面包小麦品种济南17和豫麦34灌浆期高温胁迫差异表达基因的分离. 李浩,张平平,查向东,夏先春,何中虎. 2007

[11]cDNA-AFLP技术在植物抗逆性相关基因表达研究中的应用. 郭秀林,张正斌,李景娟,李广敏. 2006

[12]QRT-PCR检测目的基因mRNA转录水平的应用. 韩天龙,王敏,李志明. 2011

[13]草鱼成纤维细胞gcngr1基因的表达分析. 焦真真,田园园,孙成飞,董浚键,姜鹏,叶星. 2017

[14]草莓果实不同发育阶段抑制差减文库(SSH)的构建及相关基因的表达分析. 周厚成,李刚,赵霞,王子成,郭蔼光. 2013

[15]稻螟赤眼蜂实时荧光定量PCR内参基因的筛选. 王珊珊,田俊策,鲁艳辉,徐红星,王香萍,吕仲贤. 2022

[16]沙棘种子高积累碳十八不饱和脂肪酸的多基因协同调控机制. 丁健,阮成江,关莹,吴立仁,单金友. 2017

[17]剑麻PGIP基因克隆和表达研究. 张燕梅,王瑞芳,杨子平,李俊峰,鹿志伟,赵艳龙,陆军迎,周文钊. 2019

[18]不同处理方式的妃子笑荔枝花穗ARF基因家族的表达分析. 董晨,魏永赞,王弋,郑雪文,李伟才. 2018

[19]贵州省干椒新品种区域试验的基因与环境互作分析. 牟玉梅,赖卫,刘崇政,姜虹,杨红. 2016

[20]辣椒细胞质雄性不育相关基因的克隆与表达分析. 刘科伟,王述彬,刁卫平,戈伟. 2017

作者其他论文 更多>>

微信小程序