陆地棉CC-NBS-LRR基因的克隆及特征分析
文献类型: 中文期刊
第一作者: 张保龙
作者: 张保龙;杨郁文;倪万潮;佘建明;沈新莲;何晓兰;张香桂;徐英俊;姚姝
作者机构:
关键词: 陆地棉;CC-NBS-LRR基因;GHNBS;基因表达
期刊名称: 江苏农业学报
ISSN: 1000-4440
年卷期: 2006 年 22 卷 04 期
页码: 351-355
收录情况: 北大核心 ; CSCD
摘要: 根据抗病基因核苷酸结合位点(Nuc leotide b ind ing site,NBS)设计简并性引物,从陆地棉cDNA中进行RT-PCR扩增。获得含NBS保守域的EST,进一步用RACE技术和TAIL PCR技术获得其中1个EST的全长基因序列,并获得GHNBS基因的5′调控序列。此基因被命名为GHNBS。该基因的编码区长2 583 bp,编码861个氨基酸,GHNBS编码的氨基酸序列与拟南芥R基因具有28%的同源性。GHNBS与拟南芥的其他几个NBS-LRR基因比较发现,它们在保守区外的相似性相当低。Southern杂交和网上数据库搜索分析都表明GHNBS是1个寡拷贝基因。通过半定量RT-PCR分析发现GHNBS在棉花的蕾、花瓣、韧皮部、根及叶中均有表达且在根、叶中表达量比其它部位强,在木质部基本不表达。
分类号: S562
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