比较转录组学分析金针菇菌柄伸长调控相关途径和基因
文献类型: 中文期刊
第一作者: 崔玉琴
作者: 崔玉琴;刘询;何晓兰;王波;万燕;彭卫红
作者机构:
关键词: 转录组学;金针菇;菌柄;伸长;基因
期刊名称: 菌物学报
ISSN: 1672-6472
年卷期: 2024 年 43 卷 012 期
页码: 65-78
收录情况: 北大核心 ; CSCD
摘要: 金针菇菌柄是其主要可食用部位,但是对菌柄伸长的调控机理的了解还不够深入,相关基因报道较少。本研究以工厂化栽培黄色金针菇为研究对象,分析菌柄上、中、下3个部位的伸长特性,并进行比较转录组学分析和qRT-PCR验证。结果显示,黄色金针菇菌柄伸长区位于上部,中部与下部相比的差异基因共532个,而上部与中部相比的差异基因达3522个。上部与中部相比的差异基因GO分子功能注释主要包括核糖体结构组成、结构分子活性、运输活性和跨膜转运蛋白活性;KEGG分析则显示上调基因显著富集到核糖体、类固醇生物合成、DNA复制等通路,下调基因显著富集到次生代谢物和氨基酸的生物合成、糖酵解等代谢途径。差异倍数最高的基因包括几丁质酶和糖基水解酶以及转录因子等,q RT-PCR结果证明转录组数据准确可靠。本研究全面展示可能参与金针菇菌柄伸长调控的途径和候选基因,为后续基因功能研究和金针菇的分子育种提供基因资源。
分类号: S646.15
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