比较转录组学分析金针菇菌柄伸长调控相关途径和基因

文献类型: 中文期刊

第一作者: 崔玉琴

作者: 崔玉琴;刘询;何晓兰;王波;万燕;彭卫红

作者机构:

关键词: 转录组学;金针菇;菌柄;伸长;基因

期刊名称: 菌物学报

ISSN: 1672-6472

年卷期: 2024 年 43 卷 012 期

页码: 65-78

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 金针菇菌柄是其主要可食用部位,但是对菌柄伸长的调控机理的了解还不够深入,相关基因报道较少。本研究以工厂化栽培黄色金针菇为研究对象,分析菌柄上、中、下3个部位的伸长特性,并进行比较转录组学分析和qRT-PCR验证。结果显示,黄色金针菇菌柄伸长区位于上部,中部与下部相比的差异基因共532个,而上部与中部相比的差异基因达3522个。上部与中部相比的差异基因GO分子功能注释主要包括核糖体结构组成、结构分子活性、运输活性和跨膜转运蛋白活性;KEGG分析则显示上调基因显著富集到核糖体、类固醇生物合成、DNA复制等通路,下调基因显著富集到次生代谢物和氨基酸的生物合成、糖酵解等代谢途径。差异倍数最高的基因包括几丁质酶和糖基水解酶以及转录因子等,q RT-PCR结果证明转录组数据准确可靠。本研究全面展示可能参与金针菇菌柄伸长调控的途径和候选基因,为后续基因功能研究和金针菇的分子育种提供基因资源。

分类号: S646.15

  • 相关文献

[1]微波法提取香菇柄多糖初步研究. 王谦,徐彩芳,王朝江. 2009

[2]香菇新品种沪香922. 章炉军,李巧珍,宋春艳,张美彦. 2024

[3]菌丝生理成熟期温度和光质对白灵侧耳生长的影响. 靖云阁,邹亚杰,杨小红,杜芳,张海军,胡清秀. 2019

[4]赤霉素诱导甘蔗节间伸长与内源激素变化的关系. 李杨瑞,杨柳,王爱勤,杨丽涛. 2009

[5]杂交中稻抽穗后再生芽生长与头季稻茎鞘物质积累的关系. 熊洪,洪松. 1997

[6]赤霉素诱导甘蔗节间伸长的效应与相关酶活性的关系. 李杨瑞,王爱勤,杨柳,杨丽涛. 2010

[7]GA_3在桉树离体培养中对芽的伸长及瓶苗质量的影响. . 2004

[8]激素浓度组合对成熟油梨枝条伸长和生根的影响. 成镜,汤倩,黄天带,顾晓川,徐正伟,彭素娜. 2024

[9]超高分子量聚乙烯绳索伸长的测定. 茅利生,郭亦萍,马海有,乐伟章. 2004

[10]网箱用纤维绳索伸长性能的试验. 郭亦萍,马海有,茅利生. 2005

[11]水稻中胚轴伸长特性的遗传分析. 林建荣,张光恒,吴明国,曹立勇,程式华. 2006

[12]转录组学在茶树研究中的应用进展. 江新凤,刘本英,李友勇,李洪波. 2018

[13]杨梅分子生物学研究现状. 倪海枝,陈方永,王引,任正初. 2015

[14]转录组学在牧草上的应用进展. 王飞,刘林波,高天歌,高鲤,包爱科,王锁民. 2019

[15]多组学关联分析作物耐逆境胁迫研究进展. 李洁,姚晓华. 2019

[16]烟蚜茧蜂滞育关联基因的转录组学分析. 安涛,张洪志,韩艳华,陈红印,张礼生. 2017

[17]昆虫病原真菌基因组学及多组学研究进展. 宋晓兵,彭埃天,凌金锋,陈霞,崔一平. 2021

[18]鸭源H7N9亚型禽流感病毒感染SPF鸡转录组学分析. 施少华,陈珍,程龙飞,傅光华,傅秋玲,刘荣昌,万春和,陈红梅,黄瑜. 2020

[19]二代测序技术在水稻基因组学和转录组学研究中的应用. 高阳,薛大伟,钱前,高振宇. 2015

[20]粗糙脉胞菌降解水稻秸秆初期转录组分析. 游灵杰,李银水,龚阳敏,顾炽明,胡小加,李越,廖星,秦璐. 2023

作者其他论文 更多>>