橄榄CaICE1基因的克隆和表达分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 赖瑞联

作者： 赖瑞联;陈瑾;冯新;程春振;韦晓霞;陈义挺;吴如健

作者机构：

关键词： 橄榄;抗寒;转录因子;ICE1;克隆;基因表达

期刊名称： 热带亚热带植物学报

ISSN： 1005-3395

年卷期： 2018 年 06 期

页码： 571-579

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 为了解橄榄(Canarium album)抗寒相关转录因子ICE1的调控功能,采用RT-PCR技术克隆了‘福榄1号’的ICE1,命名为CaICE1,并进行生物信息学、qRT-PCR表达模式和相关miRNA预测分析。结果表明,CaICE1 cDNA序列的开放阅读框长度为1 650 bp,可编码549个氨基酸(GenBank登录号MG459422)。Ca ICE1为不稳定亲水性蛋白质,含有跨膜结构、磷酸化位点以及HLH保守结构域,定位于细胞核,与枳的ICE1亲缘关系较近。CaICE1密码子偏好性较弱,AGA、AGG、TGG和CCA可能为其最优密码子群。CaICE1主要在橄榄花、种子和叶中大量表达,-3℃低温胁迫下CaICE1表达水平比常温显著上升。psRNAtarget预测结果表明,CaICE1可能是miR825、miR477、miR5658、miR1436和miR394等多个逆境响应miRNA的靶基因。因此,CaICE1可能在橄榄低温胁迫过程中发挥重要调控作用,且可能受miRNA的调控。

分类号： Q943.2`S667.5

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