海南五指山猪TLR2基因克隆及生物信息学分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 张艳

作者： 张艳;黄丽丽;刘海隆;林哲敏;谭树义

作者机构：

关键词： 海南;五指山猪;TLR2基因;克隆;生物信息学分析;序列分析

期刊名称： 黑龙江畜牧兽医

ISSN： 1004-7034

年卷期： 2017 年 17 期

页码： 37-40+44+286-287

收录情况： 北大核心

摘要： 为了探讨海南五指山猪TLR2基因的分子结构特征及相关遗传变异,为研究TLR2基因遗传变异与免疫疾病的关系打下基础,试验采用PCR技术对该基因组序列进行克隆、测序及相关生物信息学分析。结果表明:获得2 649 bp的五指山猪TLR2基因的DNA序列,其基因编码区全长2 358 bp,编码785个氨基酸;与Gen Bank中发布的普通猪TLR2基因序列相比,共发现9处突变,其中在编码区序列存在2处突变,属于有义突变;与普通猪、马、牛、绵羊、人、黑猩猩、猕猴、犬、小鼠、鸡、斑马鱼的氨基酸序列的一致性分别为99.7%、82.1%、81.4%、80.6%、78.4%、78.4%、77.8%、77.3%、68.2%、50.7%、40.4%;五指山猪TLR2编码的蛋白主要位于质膜,属于分泌性蛋白、亲水性蛋白和跨膜蛋白,有信号肽和5个糖基化修饰位点,存在较多的丝氨酸(Ser)和苏氨酸(Thr)磷酸化位点;不同物种TLR2基因在进化过程中具有较高的保守性。说明TLR2基因可作为今后研究海南五指山猪免疫疾病的重要指标之一。

分类号： Q78`S828

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