青稞转录因子HvnANT1基因的克隆与表达分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 陈林

作者： 陈林;姚晓华;苏乐平;姚有华;魏婵;吴昆仑

作者机构：

关键词： 青稞;HvnANT1;HvvnCHI;HvnANS;HvnDFR;基因表达

期刊名称： 中国农业大学学报

ISSN： 1007-4333

年卷期： 2022 年 27 卷 008 期

页码： 58-67

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 为探究HvnANT1基因在青稞粒色形成过程中的基因表达模式,以紫粒青稞'涅如姆扎'和白粒青稞'昆仑10号'为试材,利用简化基因组GBS(Genotyping-by-Sequencing)对青稞紫粒进行基因定位,克隆到HvnANT1基因,对其进行生物信息学分析.结果表明:1)在7H染色体的84.30-86.00 cM获得1个MYB类转录因子,命名为HvnANT1.2)该基因长1 033 bp,其完整开放阅读框为762 bp,编码253个氨基酸.HvnANT1蛋白分子量为27.14 kU,是亲水性的不稳定碱性蛋白且不存在跨膜结构,无信号肽.该蛋白的二级结构主要是由无规卷曲、α-螺旋、延伸链和β-转角组成,具有2个SANT结构域(分别位于第13—第63个;第66—第114个氨基酸).3)同源比对与系统进化分析表明:青稞HvnANT1蛋白与大麦、乌拉尔图小麦、高粱、玉米、二型花、小米、水稻、土瓶草、车轴草和杨梅10种植物的ANT1蛋白序列相似性分别为100.00%、88.85%、54.64%、60.95%、60.82%、58.46%、57.61%、37.76%、36.05%和36.33%;这些序列都具有2个高度保守的2个SANT结构域;与大麦的亲缘关系最近,其次是与乌拉尔图小麦,与水稻最远.4)亚细胞定位结果表明,该基因定位在细胞核内.5)实时荧光定量PCR(qRT-PCR)结果显示:与籽粒颜色形成的乳熟早期和乳熟晚期相比,软面团期的HvnANT1基因在'涅如姆扎'中表达量极显著上调,而在'昆仑10号'中各时期的表达量较低且差异不显著;且软面团期的'涅如姆扎'籽粒HvnANT1基因的表达量极显著高于'昆仑10号'(P<0.01).花青素合成相关的结构基因HvnCHI、HvnANS和HvnDFR与该基因表达量模式相似.综上,青稞HvnANT1蛋白结构中的SANT结构域在物种进化过程中比较保守;该基因定位在细胞核内,符合转录因子特性;HvnANT1基因表达模式与结构基因HvnCHI、HvnANS和HvnDFR相似,在籽粒颜色形成的软面团期表达量极显著升高.

分类号： S785%S786

  • 相关文献

[1]CoCl2胁迫下青稞苯丙氨酸解氨酶基因的克隆与表达分析. 乔枫,张丽,耿贵工,陈志,曾阳,谢惠春. 2021

[2]青稞NBS-LRR类基因HvtRGA的克隆与条纹病胁迫表达分析. 杨雪,姚晓华,安立昆,姚有华,白羿雄,吴昆仑. 2020

[3]基于转录组与染色质开放性分析青稞对白粉病胁迫的响应. 杨春葆,原红军. 2024

[4]青稞HvnWAK基因的克隆及其在条纹病胁迫下的表达. 李婷婷,姚有华,安立昆,白羿雄,杨雪,姚晓华,吴昆仑. 2024

[5]不同施氮量对青稞产量的影响. 刘国一,尼玛扎西,尼玛扎西,宋国英. 2013

[6]西藏高原地区麦作农业起源几个问题的探讨. 张亚生,金涛,尼玛扎西,关卫星,李宝海,拉巴. 1999

[7]青稞与高原地区的食物保障:优势与作用. 尼玛扎西. 1998

[8]青稞4-香豆酸辅酶A连接酶基因4CL的克隆及表达分析. 杨晓云,杨智敏,罗小娇,孔德媛,袁金娥,刘新春,冯宗云. 2014

[9]拉萨市青稞田草害及综合防控技术. 乔海龙,马裴裴,次仁琼达,杜梦娇,高磊. 2018

[10]青稞的小孢子离体培养和植株再生. 陆瑞菊,高润红,郭桂梅,何婷,陈志伟. 2014

[11]青稞饮料开发前景分析. 党斌,杨希娟,陈来生. 2009

[12]青稞蛋白的超声波辅助提取工艺及其功能特性研究. 杨希娟,党斌,吴昆仑,迟德钊,刘新红. 2013

[13]青海省青稞地方品种β-葡聚糖含量分析. 陈丽华,王燕春. 2012

[14]盐胁迫对青稞种子萌发及幼苗生长的影响. 李洁,张亚琦. 2014

[15]青海青稞三叶期叶片光合特性的研究. 段瑞君,任又成,熊辉岩. 2010

[16]青稞品质特性及加工利用现状分析. 刘新红,杨希娟,吴昆仑,迟德钊. 2013

[17]PEG预处理对青稞种子萌发和幼苗生理特性的影响. 姚晓华,吴昆仑. 2012

[18]青海栽培青稞酯酶同工酶方法研究及应用. 段瑞君,任又成,熊辉岩. 2010

[19]青海青稞灌浆期旗叶气孔特征研究. 段瑞君,任永成,熊辉岩. 2010

[20]青稞杂交最佳去雄时间研究. 王显萍,任有成,李积泰. 2007

作者其他论文 更多>>

微信小程序