利用电子PCR分析草菇基因组SSR标记多态性

文献类型： 中文期刊

第一作者： 熊登坤

作者： 熊登坤;鲍大鹏;边银丙

作者机构：

关键词： 草菇;SSR;多态性;电子PCR

期刊名称： 微生物学通报

ISSN： 0253-2654

年卷期： 2014 年 41 卷 10 期

页码： 2070-2075

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 【目的】利用电子PCR分析草菇基因组SSR标记多态性,并通过PCR验证分析结果的可靠性。【方法】利用MISA程序定位草菇基因组SSR位点并结合Primer3.0程序设计SSR分子标记引物,运用电子PCR进行SSR分子标记多态性分析,基于分析结果进行PCR验证。【结果】随机选取658对SSR引物在草菇同核体菌株V23-1和PD19中进行真实PCR检测,结果表明28.6%的SSR引物具有多态性。数据分析表明,如果SSR标记来源于电子PCR产物长度没有差异的类型,仅4.8%的SSR引物在真实PCR中表现出多态性;如果SSR标记来源于电子PCR产物长度差异大于或者等于3 bp的类型,其中至少48.3%的SSR引物在真实PCR中表现出多态性。【结论】PCR验证结果表明利用电子PCR可以提高SSR多态性引物的筛选效率。

分类号： S646.13`Q943.2

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