利用转录组挖掘羊肚菌干旱胁迫相关基因

文献类型： 中文期刊

第一作者： 仝乐涛

作者： 仝乐涛;徐爱国;鲍大鹏;王伟霞;李福后;唐利华

作者机构：

关键词： 羊肚菌;干旱;转录组;基因差异表达

期刊名称： 食用菌学报

ISSN： 1005-9873

年卷期： 2024 年 31 卷 002 期

页码： 26-33

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 为挖掘羊肚菌(Morchella sextelata)干旱胁迫相关基因,设置对照组和干旱组,每组3畦,待对照组子实体生长至黑褐色时,每畦随机取1个子实体样品,通过转录组测序和基因功能注释分析对照组与干旱组的差异表达基因,采用GO和KEGG富集分析显著富集的GO条目和KEGG代谢通路,再根据GO和KEGG富集分析结果,通过基因注释信息确定与干旱胁迫相关的关键差异表达基因,随机选择5个与干旱胁迫相关的关键差异表达基因进行荧光定量PCR验证.结果表明:对照组子实体颜色白至淡黄、外观丰满,干旱组子实体颜色偏黑褐色、外观干瘪,且子实体较小;对照组与干旱组相比,共获得2 817个差异表达基因,其中上调表达基因1 492个,下调表达基因1 325个;GO富集结果表明,差异表达基因显著富集于DNA复制、DNA依赖性DNA复制、单糖运输、蛋白质-DNA复合物、核糖体、MCM复合体、核糖体的结构成分、FAD结合能力和溶质:阳离子同向转运蛋白活性等;KEGG富集结果表明,差异表达基因主要参与DNA复制、错配修复、类固醇生物合成、核糖体、剪辑切除修复、核苷酸切除修复、甲烷代谢、淀粉和蔗糖代谢、精氨酸和脯氨酸代谢、硫铵代谢等过程;与干旱胁迫相关的18个关键差异表达基因包括转运蛋白、热激蛋白、转录因子、激酶和自噬相关基因;荧光定量PCR测定结果与转录组测序分析的关键差异表达基因结果一致.

分类号： S646.7

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