1株类NADC30与类JXA1重组的猪繁殖与呼吸综合征病毒基因组遗传特征分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 郭振华

作者： 郭振华;阮海宇;耿瑞;陈鑫鑫;乔松林;邓瑞广;张改平

作者机构：

关键词： 猪繁殖与呼吸综合征病毒;同源性分析;系统进化树;遗传变异;基因重组

期刊名称： 畜牧兽医学报

ISSN： 0366-6964

年卷期： 2020 年 51 卷 007 期

页码： 1677-1687

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 旨在分析本实验室2017年从临床病料中分离的1株猪繁殖与呼吸综合征病毒(porcine reproductive and respiratory syndrome virus,PRRSV)的分子遗传特征,测定了其全基因组序列,并运用生物信息学软件对其遗传特点进行了分析.结果显示,该毒株基因组全长15054 bp,与代表性毒株VR-2332、NADC30、CH-1a、JXA1和QYYZ的核苷酸相似性分别为84.5% 、93.4% 、84.2% 、83.9% 和82.1%.系统进化树分析显示,该毒株与NADC30-like毒株处于同一进化分支,属于lineage 1.基于GP5和Nsp2蛋白的氨基酸序列分析显示,分离株GP5蛋白糖基化位点位于34位、44位和51位;在37—45 aa的线性表位区较为保守,在27—30 aa和37—45 aa的线性表位区存在特异的氨基酸位点变异;Nsp2蛋白存在NADC30-lke毒株特征性的131个(323—433位、483位、504—522位)不连续氨基酸的缺失.基因重组分析显示,该毒株以类NADC30为主要亲本、以类JXA1为次要亲本,在Nsp2的氨基端(1340—2082 nt)发生了基因重组.本研究成功绘制了1株NADC30-like毒株的基因组遗传特征,确定了其在Nsp2区域发生了基因重组,提示PRRSV通过基因重组在不断发生遗传演化,开展持续的PRRSV流行及遗传变异监测对于该病的防控具有重要意义.

分类号： S852.659.6%S855.3

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