茉莉酸信号受体COI蛋白家族的分子进化与基因表达分析
文献类型: 中文期刊
第一作者: 段龙飞
作者: 段龙飞;李文燕;慕小倩;张园园;郭邦利;陈国爱
作者机构:
关键词: 茉莉酸信号;COI蛋白家族;系统发育;扩增与进化;基因表达
期刊名称: 生物信息学
ISSN: 1672-5565
年卷期: 2016 年 14 卷 03 期
页码: 146-155
摘要: 茉莉酸(Jasmonic acid,JA)存在于所有高等植物中,是植物对病原微生物和虫害防御反应的关键激素。在茉莉酸信号转导中,COI1(COR-insensitive 1)作为茉莉酸信号受体蛋白在其中发挥关键作用。本研究采用生物信息学方法,从藻类、苔藓类、蕨类、裸子及单、双子叶植物多谱系对COI蛋白家族进行比较基因组学研究,并取得以下结果:(1)同源基因鉴定结果发现,在所选的7种陆生植物中一共鉴定了55个COIs同源基因,然而,在低等的水生植物包括绿藻类(Chlorophytes)、红藻类(Rhodophytes)、硅藻类(Bacillariophytes)、灰胞藻类(Glaucophytes)及褐藻类(Phaeophytes)等基因组中均未发现其同源基因;(2)系统进化树分析表明,植物COI蛋白家族可以分为4个保守的亚家族,且在陆生植物扩增的同时可能已发生功能分化;(3)基因结构分析显示,植物COI家族基因结构表现多样性,主要体现在内含子的数目和长度上;(4)基因表达数据提示,COI基因家族成员参与植物生长发育的多个时期,且在不同组织器官以及不同的胁迫应答反应中发挥不同的作用。以上结果将为植物COI基因家族的深入研究提供参考。
分类号: Q943.2
- 相关文献
[1]鲤sPLA_2-Ⅲ基因结构、系统发育和表达特征. 许迪辉,李红霞,李建林,唐永凯,王钦,张磊,沈泽恩,俞菊华. 2019
[2]巴西橡胶树次生乳管分化能力的早期评价方法研究. 张世鑫,刘宁涛,杨署光,陈月异,晁金泉,田维敏. 2018
[3]橡胶树乳管细胞HblJAZ3互作蛋白的分离鉴定. 邓小敏,王靖,陈多坤,吴绍华,田维敏. 2018
[4]东居延海表层水中可培养细菌系统发育与种群多样性研究. 陈晨,王小兵,赵吉睿,王瑞刚,刘惠荣,孟建宇. 2014
[5]好氧氨氧化微生物生态学研究进展. 向燕,李建光,关梅,王金乐. 2012
[6]古菌、细菌和真核生物纤维素酶的整体进化关系(英文). 吴光. 2016
[7]叶点霉属真菌寄主(宿主)和地理分布的多样性. 吴石平,陈文,刘作易. 2015
[8]基于mtDNA COI的假眼小绿叶蝉系统发育研究. 付建玉,李乐,袁志军,唐美君,肖强. 2014
[9]核果类果树ITS序列分子进化及系统发育关系研究. 王化坤,陶建敏,渠慎春,房经贵,马瑞娟,章镇,娄晓鸣. 2010
[10]植物F-Box蛋白及其生物学功能研究. 李懿星,夏凯,宋书锋,周在为. 2010
[11]基于线粒体COI基因序列的挂墩稻弄蝶分类地位研究. 国栋,范骁凌,王敏. 2010
[12]温度和海拔对高寒草甸植物种子萌发进化特性的影响. 许静,杜国祯,李文龙,刘伟,高天鹏. 2013
[13]青海湖嗜盐微生物系统发育与种群多样性. 朱德锐,刘建,韩睿,沈国平,杨芳,龙启福,刘德立. 2012
[14]绿头鸭线粒体基因组全序列分析及河鸭类系统发育. 涂剑锋,黄银花,刘三凤,李宁. 2009
[15]日本鼓虾线粒体基因组:真虾下目内部的基因重排与系统发育. 申欣,李晓,沙忠利,阎斌伦,徐启华. 2012
[16]浙江省水稻纹枯病菌的遗传分化与致病力研究. 陈涛,张震,柴荣耀,王教瑜,毛雪琴,邱海萍,杜新法,姜华,王立安,王艳丽,孙国昌. 2010
[17]青藏高原高寒草地优势禾草—紫花针茅内生真菌分离和鉴定. 鲍根生,李春杰. 2016
[18]蛭弧菌Bdh5221株理化特性和16S rDNA序列分析. 梁思成,房文红,汪开毓,贾娴. 2009
[19]大豆基因组中TOC1同源基因的生物信息学分析. 吴卓晶,庞保平,傅永福. 2010
[20]印度谷螟线粒体基因组测定及螟蛾总科系统发育分析. 唐培安,吴海晶,王娟,郭仲龙,袁明龙. 2015
作者其他论文 更多>>
-
紫苏叶醇提物提取工艺及其抗氧化、抗菌活性研究
作者:闫小杰;白乌日力嘎;张园园;刘秀丽;史培;其力格尔其其格;乌云达来;王莉梅
关键词:紫苏叶;醇提物;抗氧化;抗菌活性
-
燕麦穗腐病病原菌鉴定及生物学特性分析
作者:贾瑞芳;王娜;王乐;陈正强;林克剑;张园园
关键词:燕麦;禾生指葡孢霉;分离;鉴定;生物学特性
-
内蒙古自治区紫花苜蓿根腐病病原菌鉴定
作者:王乐;贾瑞芳;王娜;陈正强;刘欢;林克剑;张园园
关键词:紫花苜蓿;根腐病;真菌;分子鉴定;致病性
-
不同种类燕麦籽粒对燕麦粥的品质影响
作者:江利晗;李佳;霍瑞;赵俪捷;康连和;张园园
关键词:燕麦;感官评价;相关性分析;关联度
-
不同杀菌条件对酸乳清饮料中微生物的影响
作者:郑伟;李子健;张园园;王莉梅;刘秀丽;李星云;白乌日力嘎;赵俪捷;韩云飞;刘璐;史培;乔健敏;傲特更脑日布
关键词:酸乳清饮料;杀菌条件;微生物;乳酸菌
-
基于小RNA深度测序技术对呼和浩特地区紫花苜蓿病毒病病原检测及分析
作者:陈方淇;王乐;吴杰;贾瑞芳;张园园;赵君;陈正强;林克剑
关键词:紫花苜蓿;苜蓿病毒病;小RNA深度测序;系统进化分析
-
我国茶叶产品质量标准中理化指标差异性分析
作者:李文燕;张琳;陈利燕;张颖彬;周苏娟;洪一苇;梁思辰;孙洪峰;陈红平
关键词:茶叶质量标准;理化指标;差异