绵羊PDK4基因序列克隆、分析及亚细胞定位

文献类型： 中文期刊

第一作者： 曹阳

作者： 曹阳;方文文;刘宇;刘昕昕;肖成;李欣;于长辉;曹阳

作者机构：

关键词： PDK4;绵羊;选择性多聚腺苷酸化;亚细胞定位

期刊名称： 中国畜牧杂志

ISSN： 0258-7033

年卷期： 2024 年 60 卷 011 期

页码： 359-363

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 为了明确丙酮酸脱氢酶激酶4(Pyruvate Dehydrogenase Kinase 4,PDK4)基因的结构，利用c DNA末端快速扩增技术（RACE），以绵羊脂肪组织总RNA为模板扩增得到绵羊PDK4基因全部序列，使用生物信息学软件对扩增得到的序列进行分析，并预测其蛋白结构，通过免疫荧光染色观察PDK4亚细胞定位，RT-PCR检测其在绵羊各组织中的表达。结果表明：绵羊PDK4基因序列共存在6个转录本，其中最长转录本长度为4 018 bp,5'UTR为289 bp，开放阅读框长为1 224 bp,3'UTR存在选择性多聚腺苷酸化（Alternative Polyadenylation,APA）现象，有6条不同长度的3'UTR，分别为120、512、672、1 418、2 245、2 505 bp，其中编码区共编码407个氨基酸，理论分子质量为46.21 ku，等电位点为6.90，为亲水性蛋白，无信号肽，不属于分泌蛋白，与其他物种PDK4进行同源性比对，发现其与牛和山羊的同源性最高；预测其亚细胞定位于线粒体、细胞质和核，通过免疫荧光染色将PDK4与线粒体和细胞核共定位，结果发现其在线粒体表达中较多，少量存在与细胞核中；检测PDK4基因在40日龄羔羊各组织中表达水平，其在肌肉组织中表达最高，在肺中表达最低。本研究通过对绵羊PDK4全序列克隆、蛋白结构分析以及亚细胞定位，为绵羊PDK4的后续研究提供了有效信息和理论依据。

分类号： S826.2

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