牙鲆微卫星标记的筛选及群体遗传结构分析
文献类型: 中文期刊
第一作者: 王蕾
作者: 王蕾;张立冬;万玉美;谭照君;孙效文
作者机构:
关键词: 牙鲆;微卫星;遗传结构
期刊名称: 遗传
ISSN: 0253-9772
年卷期: 2010 年 32 卷 10 期
页码: 1057-1064
收录情况: 北大核心 ; CSCD
摘要: 采用生物素-磁珠吸附微卫星与质粒二次检测相结合的方法克隆牙鲆微卫星,并利用所得到的引物分析野生群体遗传结构。共获得2805个阳性克隆,测序得到3120个含微卫星的序列。其中完美型、非完美型和混合型分别占57.97%、7.25%和34.78%。用Primer3.0软件设计牙鲆微卫星引物,从中筛选出具稳定多态性的30对,分析中国黄海、渤海海域4个不同海区牙鲆野生群体(大连、北戴河、丹东、青岛)遗传结构。结果显示:有效等位基因数为3.93~9.94,平均为6.95;观测杂合度为0.532~0.895,平均为0.753;期望杂合度为0.635~0.902,平均为0.820;Hardy-Weinberg平衡指数(d)的变化范围为-0.247~0.512,其中7个位点表现为杂合子过剩(d>0),其余位点表现为杂合子缺失(d<0)。聚类分析显示:4个群体聚为两类,大连与丹东聚为一类,北戴河与青岛聚为一类。
分类号: S917.4
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