4份临床样品中羊口疮病毒F1L、B2L和GIF基因的进化分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 林裕胜

作者： 林裕胜;刘维巍;张龙;江锦秀;张靖鹏;刘庆华;胡奇林

作者机构：

关键词： 羊口疮病毒;F1L基因;B2L基因;GIF基因;进化分析

期刊名称： 福建农业学报

ISSN： 1008-0384

年卷期： 2022 年 006 期

页码： 748-753

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 【目的】研究2021年福建省部分羊场羊口疮病毒（Orf virus, ORFV）分子流行病学情况。【方法】对2021年采集的4份病料经PCR鉴定ORFV阳性的临床样品分别克隆其F1L、B2L和GIF基因，将获得的克隆质粒送往测序公司进行测序，将测序拼接后的序列上传至GenBank数据库中，利用生物信息学软件进行对比分析。【结果】4份临床样品中ORFV的F1L、B2L和GIF基因核苷酸序列相似性分别为98.0%～98.8%、98.4%～99.5%和97.2%～99.6%；与国内流行毒株核苷酸序列相似性分别为97.4%～99.4%、97.4%～99.9%和95.7%～99.0%；与国外流行毒株核苷酸序列相似性分别为97.5%～98.6%、97.9%～98.9%和95.6%～98.0%；与德国D1701弱毒株核苷酸序列相似性分别为96.5%～96.8%、98.0%～98.7%和96.0%～96.4%，与NZ2参考株核苷酸序列相似性分别为97.7%～98.1%、97.5%～98.1%和95.9%～96.1%。遗传进化树结果显示4份临床样品中ORFV与吉林（NA17、SY17和CL18株）、福建SJ1株和印度MP株亲缘关系较近；与美国OV-IA82株、德国D1701弱毒株、新西兰NZ2参考株和中国疫苗株亲缘关系较远；表明当前流行毒株可能是本省毒株、国内吉林GZ18株和国外印度MP株的重组毒株。【结论】获得4份临床样品中ORFV B2L、F1L和GIF基因序列并上传至GenBank数据库中，丰富了ORFV相关基因序列的数据库，同时阐明福建省部分羊场当前ORFV的流行特征，为福建省今后有效防控Orf提供理论依据。

分类号： S852.65

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