禾谷丝核菌基因组SSR标记的开发及评价

文献类型： 中文期刊

第一作者： 李伟

作者： 李伟;张兴;孙海燕;邓渊钰;张爱香;马东方;陈怀谷

作者机构：

关键词： 小麦纹枯病;禾谷丝核菌;群体遗传学;微卫星

期刊名称： 植物病理学报

ISSN： 0412-0914

年卷期： 2017 年 04 期

页码： 487-494

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 群体遗传学研究对于了解病原菌的流行、变异及进化规律具有重要意义。但是到目前为止,对小麦纹枯病菌禾谷丝核菌群体遗传结构的了解并不深入,缺乏有效的SSR标记是主要原因。本研究根据禾谷丝核菌全基因组序列进行了微卫星位点搜索并设计SSR引物,通过电泳筛选和测序验证,最终筛选出12个多态性较好且稳定可靠的SSR标记。利用这些标记对收集自我国安徽、江苏、河南三省的23个禾谷丝核菌菌株进行了多态性分析,结果发现禾谷丝核菌基因组中长片段微卫星位点较少。12对引物扩增出的等位基因数平均为6.1个,期望杂合度平均为0.651,观测杂合度平均为0.508,表明这些标记具有较高的多态性,能够满足禾谷丝核菌群体遗传学研究需要。本研究为进一步进行禾谷丝核菌的多样性、群体遗传结构分析及进化学研究提供了有效工具。

分类号： S435.121.4

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